Job Description P37661 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 269 % Identity 18% Template c3q3qA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of spap: an novel alkaline phosphatase from2 bacterium sphingomonas sp. strain bsar-1 Resolution 1.95 Å

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		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.			280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.			.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.														.	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.														.	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	Q	A	P	Q	N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	G	Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	.	.	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	T	.	.	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F	V	R	Q	G	G	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.														.	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.											.	.														.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.
Template Sequence		A	A	R	S	I	A	A	T	P	P	K	L	I	V	A	I	S	V	D	Q	F	S	A	D	L	F	S	E	Y	R	.	.	Q	Y	Y	T	G	G	L	K	R	L	T	S	E	G	A	V	F	P	R	G	Y	Q	S	H	A	A	T	E	T	C	P	G	H	S	T	I	L	T	G	S	R	P	S	R	T	G	I	I
Template Known Secondary structure						T	T	S	S			S								T	T										G	.	.	G	G			S									S										S	S			S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
																																308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	D	N	P	Q	R	T	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	N	N	W	F	D	L	D	A	K	R	E	D	K	N	L	Y	C	A	E	D	E	S	Q	P	G	S	S	S	D	K	Y	E	A	S	P	L	H	L	K	V	P	T	L	G	G	R	M	K	A	A	N	P	A	T	R	V	V	S	V	A	G	K	D	R	A	A	I	M	M	G	G	A	T	A	D	Q	V	W	W
Template Known Secondary structure		S	S					T	T		S	S	S						T	T	B		T	T	S	T	T		B	T	T	B			B		S	T	T			S												T	T								S	S										T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
																																															338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A	Y	R	E	Q	I	G	A	E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	D	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	G	P	Q	G	Y	V	S	Y	K	G	V	A	P	T	P	L	V	T	Q	V	N	Q	A	F	A	Q	R	L	A	Q	P	N	P	G	F	E	L	P	A	Q	C	V	S	K	D	F	P	V	Q	A	G	N	R	T	V	G	T	G	R	F	A	R	D	A	G	D	Y	K	G	F	R	I	S	P	E	Q	D	A
Template Known Secondary structure				S	T	T					S	T	T																			T	S		B							G	G	G	G	G	G							T	T				S						B		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.					.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.
Query Sequence		L	L	V	D	E	M	Q	Q	S	L	G	R	.	.	.	.	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	S	G	C	T	K	A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V
Query Conservation														.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	L	A	F	A	A	A	A	I	E	N	M	Q	L	G	K	Q	A	Q	T	D	I	I	S	I	G	L	S	A	T	D	Y	V	G	H	T	F	G	T	E	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	C	I	Q	V	D	R	L	D	T	E	L	G	A	F
Template Known Secondary structure														T	T	T	T	S	S	S	S																				S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		449	450	.	.	.	.			.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	Q	V	R	D	.	.	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	K	L	D	K	D	G	I	D	Y	V	V	V	L	T	A	D	H	G	G	H	D	L	P	E	R	H	R	M	N	A	M	P	M	E	Q	R	V	D	M	A	L	T	P	K	A	L	N	A	T	I	A	E	K	A	G	L	P	G	K	K	V	I	W	S	D	G	P	S	G	D	I	Y	Y	D	K	G	L	T
Template Known Secondary structure								T	T										S											T	T	T	T		T	T						G	G	G	S													T		T	T	S						S	S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
																																																																										468	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	N	E	R	E	H	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	Q	R	A	R	V	E	T	E	A	L	K	Y	L	R	A	H	P	Q	V	Q	T	V	F	T	K	A	E	I	A	A	T	P	S	P	S	G	P	P	E	S	W	S	L	I	Q	E	A	R	A	S	F	Y	P	S	R	S	G	D	L	L	L	L	L	K	P	R	V	M	S	I	P	E	Q	A	V	M	G	S
Template Known Secondary structure																			S	T	T												T	S					S		G	G	G										T			T	T	T	S		S							T	T			S	S				S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	G	T	P	R	E	L	A	P	P	E	Q	F	R	V	P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M	G	C	L	G	Y	T	S	P	D	G	G	I
Query Conservation
Alig confidence								.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	T	H	G	S	.	P	W	D	T	D	R	R	V	P	I	L	F	W	R	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Q	H	F	E	Q	P	L	G	V	E	T	V	D	I	L	P	S	L	A	A	L	I	K	L	P	V	P	K	D	Q	I
Template Known Secondary structure								.	S	S													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S				G	G	G									T	T					G	G	G
Template Predicted Secondary structure								.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.		.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.																510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.