Job Description P37661 Confidence 98.26% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 276 % Identity 14% Template c2x98A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: h.salinarum alkaline phosphatase Resolution 1.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.						.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	.	.	.	.	.	T	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	P	A	A	N	A	I	A	Y	I	V	D	G	M	G	Q	T	Q	I	S	A	A	R	Y	L	N	A	Y	K	T	A	P	E	R	F	P	L	N	V	S	P	A	E	T	P	T	G	F	D	A	F	S	S	R	G	S	M	T	T	F	P	D	D	P	Y	E	T	T	T	D	S	A	A	A	A	T	A	F	A
Template Known Secondary structure				S		S																												T	T	T	T	T	G	G	G	S	T	T	T	S			T	G	G	G	S	S												S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.								.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	R	T	.	.	.	.	.	.	.	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	A	M	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A	Y	R	E	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	V	K	T	Y	N	G	A	I	G	G	V	Q	T	S	G	G	G	F	Q	R	V	D	T	V	L	E	R	A	S	A	Q	G	Y	A	T	G	L	I	T	T	T	E	A	T	H	A	T	P	A	A	F	A	A	H	V	E	D	R	G	N	Q	T	E	I	A	R	Q	Y	I	E	E	T	Q	P	D	V	I	L
Template Known Secondary structure			S					T	T		B	S					T	T	T																T											T	T	S										B	S	S	T	T												T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
			359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380											.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	G	A	E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	D	M	L	L	V	D	E	M	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	S	G	C	T	K
Query Conservation		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.															.	.
Template Conservation																																												.															.	.
Template Sequence		G	G	Q	R	R	D	F	E	A	D	A	S	N	G	G	T	L	V	D	A	A	R	D	N	G	Y	T	I	A	E	T	A	A	E	L	D	A	V	D	D	P	P	.	V	L	G	L	F	S	Q	E	S	H	L	D	Y	Y	.	.	L	D	R	K	N	D	P	E	N	T	Q	P	N	L	D	A	M	V	D	A	G
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	G	S	B		S	S	S	S	B								T	T						S									S	S		.							S	S	S						.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.															.	.
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.		.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.			260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		428	.	430	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.			.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.				.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.												.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.												.	.	.
Query Sequence		A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	V	R	D	.	.	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	.	.	.	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.												.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	D	L	L	S	S	A	G	D	P	D	K	G	F	F	L	L	V	E	S	G	R	V	D	H	A	G	H	A	N	Y	P	A	Q	V	A	E	Q	Y	E	A	T	Q	V	A	G	Q	L	V	E	Y	A	E	T	T	A	E	P	T	F	L	V	S	T	G	D	H	E	C	G	G	L	T	L	G	R	D	S	P	Y
Template Known Secondary structure								S	S		S	S											S								T		T	T																							S	S													S			B	S	S		S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		476	.	.	.																																																																		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	G	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	L	A	P	P	E	Q	F	R	V
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	E	Y	D	V	L	A	A	Q	K	A	T	T	S	R	L	R	D	L	L	A	G	V	R	S	A	D	E	L	E	S	I	V	A	A	H	T	G	I	T	A	L	T	D	R	E	V	A	K	L	R	D	A	P	G	S	I	S	T	I	L	A	E	R	A	G	I	A	F	T	T	D	G	H	T	G	T	D	V
Template Known Secondary structure													S										T	T															S	S																G	G	G										T		B				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M	G	C	L	G	Y	T
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	F	A	H	G	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	R	F	D	A	A	R	D	N	T	A	V	A	D	A	L	A	A	A	L	G	V	S
Template Known Secondary structure							S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	S	S				T	T											T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.																		.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.