Job Description P37661 Confidence 99.02% Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 222 % Identity 14% Template c2d1gB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:acid phosphatase; PDBTitle: structure of francisella tularensis acid phosphatase a (acpa) bound to2 orthovanadate Resolution 1.75 Å

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		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.			280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.													.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.													.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	.	.	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	.	T	A	T	K	L	S	L	R	C	M	F	V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.													.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.													.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	G	N	T	V	T	A	L	W	N	Y	A	Q	N	F	A	L	N	D	N	T	F	G	T	T	F	G	P	S	T	P	G	A	L	N	L	V	A	G	A	N	G	P	A	M	S	P	S	G	N	L	E	N	I	E	N	N	Y	I	I	D	D	P	N	P	Y	Y	D	D	C	S	Y	G	T	S	K	S	G	D
Template Known Secondary structure				T	T	T	S										S				S	S				S	S	S	S												S				S				T	T		S	T	T	T			T	T				S					S	S		G	G	G	S	T	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
								314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	R	T	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	A	M	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	T	A	V	A	K	I	T	D	G	Y	N	I	G	H	Y	L	T	Q	K	G	I	T	W	G	W	F	Q	G	G	F	K	P	T	S	Y	S	G	K	T	A	I	C	D	A	M	S	T	N	K	F	G	V	K	S	R	D	Y	I	P	H	H	E	P	F	N	Y	W	K	E	T	S	N	P	H	H	L	A	P
Template Known Secondary structure		T	T	S							S												T								T	T		S		S				T	T											T	T	S					S			G	G	G		G	G	G	G	S	S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure																																												.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.
Query Sequence		Y	R	E	Q	I	G	A	E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	D	M	L	L	V	D	E	M	Q	Q	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	.	.	.	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G	V	D	S	G	C	T	K	A	Q	M
Query Conservation																																												.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.												.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	D	K	Y	I	G	S	N	D	Q	A	N	H	Q	Y	D	I	S	E	F	W	K	A	L	D	.	.	.	.	.	Q	N	N	M	P	A	V	S	Y	L	K	A	P	G	Y	Q	D	G	H	G	G	Y	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		G	G	G	T	T	S	B	S	T	T	T	T				T									.	.	.	.	.	T	T				S								G	G	G	S			T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.						.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.					.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.				.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.																																		.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.																																		.	.	.
Query Sequence		I	N	S	Y	D	N	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	V	R	D	.	.	.	.	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L	H	G	T	P	R	E	L	A	P	P	E	Q	.	.	.	F	R	V	P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N
Query Conservation																										.	.	.	.																																		.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.																																		.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	L	D	E	Q	E	W	L	V	N	T	I	N	R	I	Q	Q	S	K	D	W	D	S	T	A	I	I	I	I	Y	D	D	S	D	G	D	Y	D	H	V	Y	S	P	K	S	Q	F	S	D	I	K	G	R	Q	G	Y	G	P	R	L	P	M	L	V	I	S	P	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																		S	T	T	G	G	G								S			T	T											T	T	T	T	S	T	T							B							S	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M	G	C	L	G	Y	T	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	K	A	N	Y	V	D	H	S	L	L	N	Q	A	S	V	L	K	F	I	E	Y	N	W	G	I	G	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	B		S	S									T												T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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