Job Description P21169 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 371 % Identity 13% Template d2bwna1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.1

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		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.					.	.	.	120	.	.	.	.					.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.									.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.									.	.	.	.
Query Sequence		L	E	S	A	A	C	Q	Y	E	E	N	L	L	P	P	F	Y	D	T	L	T	Q	Y	V	E	M	G	N	S	.	.	.	.	T	F	A	C	P	G	H	Q	.	.	.	.	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G
Query Conservation																															.	.	.	.									.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.									.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		L	D	K	A	I	Q	K	L	H	D	E	G	R	Y	R	T	F	I	D	I	E	R	E	K	G	A	F	P	K	A	Q	W	N	R	P	D	G	G	K	Q	D	I	T	V	W	C	G	N	D	Y	L	G	M	G	Q	H	P	V	V	L	A	A	M	H	E	A	L	E	A	V	G	A	G	.	.	S	G	G	T	R
Template Known Secondary structure												T	T												T	T	S	T	T							T	T	S									S		S		T	T	S	G	G	G																	S		.	.			S	B	T
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.			80	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.
Query SS confidence																																																	.	.
Query Sequence		D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	R	G	.	.	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S
Query Conservation																																																	.	.
Alig confidence																														.																			.	.																.
Template Conservation																														.																																				.
Template Sequence		N	I	S	G	T	T	A	Y	H	R	R	L	E	A	E	I	A	G	L	H	Q	K	E	A	A	L	V	F	.	S	S	A	Y	N	A	N	D	A	T	L	S	T	L	R	V	L	F	P	G	L	I	I	Y	S	D	S	L	N	H	A	S	M	I	E	.	G	I	K	R	N	A	G	P	K	R	I	F	R	H	N
Template Known Secondary structure		T	T	B																	T	T		S						.	S																	S	T	T							T	T								.					S									T	T
Template Predicted Secondary structure																														.																																				.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.		.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	V	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E
Query Conservation																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	A	H	L	R	E	L	I	A	A	D	D	P	A	A	P	.	.	.	.	.	.	K	L	I	A	F	E	S	V	Y	S	M	D	G	D	F	G	P	I	K	E	I	C	D	I	A	E	E	F	G	A	L	T	Y	I	D	E	V	H	A	V	G	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S		T	T	S		.	.	.	.	.	.							S	B		T	T	T			B														T								T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.							180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	P	R	G	A	G	V	A	E	R	D	G	L	M	H	R	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	N	G	T	L	A	A	Y	G	V	F	G	G	Y	I	A	A	S	A	R	.	.	.	.	.	.	.	M	V	D	A	V	R	S	Y	A	P	G	F	I	F	S	T	S	L	P	P	A	I	A	A	G
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S								T		G	G	G		S	.	.	.	.	.	.	.	.											S											.	.	.	.	.	.	.														T	S	B
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240									.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.								.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	A	S	I	A	F	L	K	T	A	E	G	Q	K	L	R	D	A	Q	Q	M	H	A	K	V	L	K	M	R	L	K	A	L	G	M	P	I	I	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	S																									T			B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.								.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	.	.	.	.	.	.	.	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	S	H	I	V	P	V	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	P	V	H	T	K	A	V	S	D	M	L	L	S	D	Y	G	V	Y	V	Q	P	I	N	F	P	T	V	P	R	G	T	E	R	L	R	F	T	P	S	P	V	H	D	L	K	Q	I	D	G	L	V	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										T	T	T	S		T	T										T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									329	330	.	.	.	.	.	.	.											.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	A	Q	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	M	D	L	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.