Job Description P21169 Confidence 99.88% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 41 Aligned Residues 362 % Identity 18% Template d1fc4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.00

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		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Y	E	E	N	L	L	P	P	F	Y	D	T	L	T	Q	Y	V	E	M	G	N	S	T	F	A	C	P	G	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G	D	L	L	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.							.	.	.	.	.	.	.													.	.				.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.							.	.	.	.	.	.	.													.	.				.
Template Sequence		H	X	R	G	E	F	Y	Q	Q	L	T	N	D	L	E	T	A	R	A	E	G	L	F	K	E	E	R	I	.	I	T	S	A	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	A	D	I	T	V	A	D	G	S	H	V	I	.	.	N	F	C	.	A	N	N	Y	L	G	L	A	N	H	P	D	L	I	A	A	A	K	A	G
Template Known Secondary structure																					T	T								.	B		S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	S				B	T	T	S					.	.				.		S		T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																														.							.	.	.	.	.	.	.													.	.				.
Template SS confidence
		0	.	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.		.	.	30	.	.	.								.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
																			165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																																			.
Template Conservation																																									.																																			.
Template Sequence		X	D	S	H	G	F	G	X	A	S	V	R	F	I	C	G	T	Q	D	S	H	K	E	L	E	Q	K	L	A	A	F	L	G	X	E	D	A	I	L	.	Y	S	S	C	F	D	A	N	G	G	L	F	E	T	L	L	G	A	E	D	A	I	I	S	D	A	L	N	H	A	S	I	I	D	.	G	V	R	L	C
Template Known Secondary structure							S				S																							T		S					.		S								T	T							T	T							T	T								.				T	S
Template Predicted Secondary structure																																									.																																			.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.		.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	V	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		K	A	K	R	Y	R	Y	A	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	X	Q	E	L	E	A	R	L	K	E	A	R	E	A	G	A	.	.	.	R	H	V	L	I	A	T	D	G	V	F	S	X	D	G	V	I	A	N	L	K	G	V	C	D	L	A	D	K	Y	D	A	L	V	X
Template Known Secondary structure			S							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T		.	.	.	S	S							S			T	T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.																.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.				.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	D	S	H	A	V	G	F	V	G	E	N	G	R	G	S	H	E	Y	C	D	V	X	G	R	V	D	.	.	.	.	I	I	T	G	T	L	G	K	A	L	G	G	A	S	G	G	Y	T	A	A	R	K	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	L	R	Q	R	S	R	P	Y	L	F	S	N
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	T	T	S	S	T	T	S							T	T		T	T			S	.	.	.	.						S	S	S	T	T		S	S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.													S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.					.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.										.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G
Query Conservation
Alig confidence																					.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	A	P	A	I	V	A	A	S	I	K	V	L	E	X	V	E	A	.	.	G	S	E	L	R	D	R	L	W	A	N	A	R	Q	F	R	E	Q	X	S	A	A	G	F	T	L	A	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T	.	.																						T	T			B			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.			.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.								.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	.	.	.	.	.	.	.	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	A	I	I	P	V	X	L	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	V	A	Q	K	F	A	R	E	L	Q	K	E	G	I	Y	V	T	G	F	F	Y	P	V	V	P	K	G	Q	A	R	I	R	T	Q	X	S	A	A	H	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T								T	T	S	S		T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.												.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	E	Q	I	T	R	A	V	E	A	F	T	R	I	G	K	Q	L
Template Known Secondary structure																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.