Job Description P21169 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 445 % Identity 14% Template d1ejia_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.90

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		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.
Query SS confidence																																											.
Query Sequence		N	G	N	E	Q	Q	W	L	E	L	E	S	A	A	C	Q	Y	E	E	N	L	L	P	P	F	Y	D	T	L	T	Q	Y	V	E	M	G	N	S	T	F	A	.	C	P	G	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K
Query Conservation																																											.
Alig confidence																																											.					.	.	.	.	.	.	.	.													.									.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.													.									.
Template Sequence		D	R	D	A	T	L	W	A	S	H	E	K	X	L	S	Q	P	L	K	D	S	D	A	E	V	Y	S	I	I	K	K	E	S	N	R	Q	R	V	G	L	E	L	I	A	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	N	F	A	S	R	A	V	L	E	A	L	G	.	S	S	L	N	N	K	Y	S	.	E	G	Y	P
Template Known Secondary structure		S	S	S											T	T	S						T																S	S					T	T		.	.	.	.	.	.	.	.												T	.	S	G	G	G	G				.		S		S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.													.									.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.									.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.		.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.					190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		L	G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	.	.	.	.	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	.	.	.	.	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	A
Query Conservation															.	.	.	.																				.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																				.	.	.	.																																		.
Template Conservation																																																																											.
Template Sequence		G	Q	R	Y	Y	G	G	T	E	F	I	D	E	L	E	X	L	C	Q	K	R	A	L	Q	A	Y	H	L	D	P	Q	C	W	G	V	N	V	Q	P	Y	S	G	S	P	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	V	E	P	H	G	R	I	X	G	L	D	L	P	D	G	G	H	L	T	H	.	G	F	X	T	D	K
Template Known Secondary structure		S	S		S	S	S																				T	T			T	T	T								S	S													T		T	T								G	G	G	T			G	G	G	.			B		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																											.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	.	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	V	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	I	S	A	T	S	I	F	F	E	S	X	P	Y	K	V	Y	P	E	T	G	Y	I	N	Y	D	Q	L	E	E	N	A	S	L	F	H	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	I	A	G	T	S	C	Y	S	R	N	L	D	Y	A	R	L	R	K	I	A	D	D	N	G	A	Y	L	X	A
Template Known Secondary structure			B		S						S							B		T	T	T		S	B															S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			S														T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.											.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.						.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	.	.	.	.	.	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.									.				.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.									.				.	.	.	.
Template Sequence		D	X	A	H	I	S	G	L	V	A	A	.	.	.	.	G	V	V	P	S	P	F	E	.	H	C	H	.	.	.	.	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	R	G	C	R	A	G	X	I	F	Y	R	K	G	V	R	S	V	D	P	K	T	G	K	E	T	Y	Y	E	L	E	S	L	I	N	S	A	V	F	P
Template Known Secondary structure				G	G	G						T	.	.	.	.	T	S	S			G	G	G	.	T		S	.	.	.	.						S	S	G	G	G				S															S	T	T																	T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.									.				.	.	.	.
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.					.	240	.	.	.	.	.	.		.	.	.					250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	Q	G	G	P	H	N	H	A	I	A	G	V	A	V	A	L	K	Q	A	X	T	T	E	F	K	I	Y	Q	L	Q	V	L	A	N	C	R	A	L	S	D	A	L	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T			S																	T	S																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	L	G	Y	K	I	V	T	G	G	S	.	.	.	D	N	H	L	I	L	X	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	K	G	T	D	G	G	R	A	E	K	V	L	E	A	C	S	I	A	C	N	K	N	T	C	P	G	D	K	S	A	L	R	P	S	G	L	R	L	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	T			B	T	T	S	S		.	.	.	S	S	S						G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T													T	T				B					S	S	S	S		T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									345	.	.	.	.	350	.	.	.	.				.	.	.	.	.	360	.	.	.											.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I	E	D	D	S	P	L	V	E	V	L	P	S	V	Y	N	K	Y	P	V	R	Y	R	D	Y	T	L	R	Q	L	C	Q	E	M	H	D	L	Y	V	S	F	D	V	K	D	L	Q	K	A	M	F	R	Q
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	A	L	T	S	R	G	L	L	E	E	D	F	Q	K	V	A	H	F	I	H	R	G	I	E	L	T	L	Q	I	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H
Template Known Secondary structure							T	T	T																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.																																															.
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		Q	S	F	P	S	V	V	M	N	P	Q	D	A	H	S	A	Y	I	R	G	D	V	E	L	V	R	I	R	D	A	E	G	R	I	A	A	E	G	A	L	P	Y	P	.	P	G	V	L
Query Conservation																																													.
Alig confidence																		.	.	.	.																								.
Template Conservation																		.	.	.	.
Template Sequence		X	A	T	K	A	T	L	K	E	F	K	E	K	L	A	G	.	.	.	.	D	E	K	I	Q	S	A	V	A	T	L	R	E	E	V	E	N	F	A	S	N	F	S	L	P	G	L	P
Template Known Secondary structure		T		S	S												S	.	.	.	.		S	T	T																T	T	S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.					.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.