Job Description P21169 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 333 % Identity 14% Template c3pj0D_ PDB info PDB header:lyase Chain: D: PDB Molecule:lmo0305 protein; PDBTitle: crystal structure of a putative l-allo-threonine aldolase (lmo0305)2 from listeria monocytogenes egd-e at 1.80 a resolution Resolution 1.80 Å

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		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	F	A	C	P	G	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.																																.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.																																.
Template Sequence		T	P	Y	K	L	G	G	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	N	V	G	V	L	T	E	A	L	Q	N	I	D	.	.	D	N	L	E	S	.	.	D	I	Y	G	N	G	A	V	I	E	D	F	E	T	K	I	A	K	I	L	G	K	Q	S	A	V	F	F	P	S	G	.	T	X	A	Q
Template Known Secondary structure			S			S	S	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S								T	T	T	S		.	.	T	T				.	.		B	T	T	B	S															T		S						S			.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.						.	.																																.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20												.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.			.	.	.	.	40			.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.
		196	.	.	.	200	.	.	.			.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.			.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure										.	.																				.	.
Query SS confidence										.	.																				.	.
Query Sequence		K	V	V	T	N	A	L	L	.	.	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	.	.	A	L	I	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L
Query Conservation										.	.																				.	.
Alig confidence										.	.																				.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	A	L	R	I	W	A	D	R	K	E	N	R	R	V	A	Y	H	P	L	S	H	L	E	I	H	E	Q	D	G	L	K	E	L	Q	Q	I	T	P	L	L	L	G	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	L	T	I	D	D	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	R	E
Template Known Secondary structure													T								T	T						S	S	T	T														S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.												.	.	.	.	.	.	.	.	130	.										.	.	.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.				290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	V	.	.	.	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																															.	.	.														.	.	.	.									.
Template Conservation																																																					.	.	.														.	.	.	.									.
Template Sequence		P	V	S	S	V	L	I	E	L	P	Q	R	E	I	G	G	Q	L	P	A	F	E	E	L	E	K	I	S	E	Y	C	H	E	Q	G	I	S	L	H	L	D	G	A	R	L	W	E	I	T	P	F	.	.	.	Y	Q	K	S	A	E	E	I	C	A	L	F	D	.	.	.	.	S	V	Y	V	S	F	Y	G	.
Template Known Secondary structure				S						S	S	B	G	G	G	T	S	B																		T								T	T		G	G	G				.	.	.		T								T	T		S	.	.	.	.									.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.														.	.	.	.									.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.				.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.					200	.	.	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		I	G	G	I	A	G	A	I	L	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	D	F	V	Q	E	A	K	I	W	K	R	R	Y	G	G	D	L	I	S	L	Y	P	Y	I	L	S	A	D	Y	Y	F	E	K	.	R	I	G	K	X	A	E	Y	F	E	A	A	K	G	L	A	E	R	F	N
Template Known Secondary structure					S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T				S																.		G	G	G
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.														220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	C	S	G	V	K	T	V	P	E	V	P	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	X	F	H	V	Y	F	E	N	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	I
Template Known Secondary structure		T	S	T	T					S	S	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.												300	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.					.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540			.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence																.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	.	.	.	.	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	.	.	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I
Query Conservation																.	.	.	.																			.	.
Alig confidence																.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	I	L	T	K	I	Q	D	E	T	G	V	G	I	S	G	Y	L	Q	E	K	S	A	D	V	C	A	F	E	V	S	V	G	D	A	F	A	E	I	P	A	K	N	L	E	L	V	F	R	C	L	E	K	E	L
Template Known Secondary structure																		S							T	T								B		G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.