Job Description P21169 Confidence 98.79% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 237 Aligned Residues 318 % Identity 16% Template c3n5mD_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; PDBTitle: crystals structure of a bacillus anthracis aminotransferase Resolution 2.05 Å

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		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.										.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Query Sequence		H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	A	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.
Template Sequence		S	H	E	P	A	I	K	L	A	E	K	L	N	E	W	L	G	G	E	Y	V	I	F	F	S	N	S	G	S	E	A	N	E	T	A	F	K	I	A	R	Q	Y	Y	A	Q	K	G	E	P	H	R	Y	K	F	X	S	R	Y	R	G	Y	H	G	N	T	X	.	A	T	X	A	A	T	G	Q	A	Q	R	R	Y
Template Known Secondary structure																		T	S								S	S																		T	T	T		T	T								T	T					S	S		.					S				G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
												230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.				.	.	.	.	.	.	290	.				.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.									.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.									.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	.	.	.	T	Y	D	G	T	V	Y	N	.	.	.	A	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.									.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.									.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Y	E	P	F	A	S	G	F	L	H	V	T	P	P	D	C	Y	R	X	P	G	I	E	R	E	N	I	Y	D	V	E	C	V	K	E	V	D	R	V	X	T	W	E	L	S	E	T	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	I	X	E	P	I	I	T	G	G	G	I	L	X	A	P	Q	D	Y	X	K
Template Known Secondary structure		T	T					S										T	T	T	S	T	T	T	T	T	S		G	G	G																G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	B	T	T	T	T		B				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.									.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.																					.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.																					.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	H	E	T	C	Q	K	H	G	A	L	L	I	S	D	E	V	I	.	.	.	C	G	F	G	R	T	G	K	A	F	G	F	X	N	Y	D	V	K	P	D	.	.	.	.	I	I	T	X	A	K	G	I	T	S	A	Y	L	P	L	S	A	T	A	V	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T								T	T	.	.	.	T	T	T	T	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	T	T				S	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.																					.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.				.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.					.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.										.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	E	I	Y	E	A	F	K	G	K	G	E	Y	E	F	F	R	H	I	N	T	F	G	G	N	P	A	A	C	A	L	A	L	K	N	L	E	I	I	E	N	E	N	L	I	E	R	S	A	Q	X	G	S	L	L	L	E	Q	L	K	E	E	I	G	E	H	P	L	V	G	D	I	R	G	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.				G	G	G		S	S	S	T	T		S						S	S	S	S																		T	T																					T	T	S	T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	V	G	I	E	L	V	N	D	K	E	T	K	E	P	I	D	N	D	K	.	.	.	.	I	A	S	V	V	N	A	C	K	E	K	G	L	I	I	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S										T	T	T	T								.	.	.	.											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
																																									373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.					.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		525							.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	.	.	.	.	.	.	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H
Query Conservation			.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	G	X	T	T	A	G	Y	N	N	I	L	T	L	A	P	P	L	V	I	S	S	E	E	I	A	F	V	I	G	T	L	K	T	A	X	E	R
Template Known Secondary structure				T	T	S	S	T	T											T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.