Job Description P21169 Confidence 99.85% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 59 Aligned Residues 355 % Identity 12% Template c3k40B_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:aromatic-l-amino-acid decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of drosophila 3,4-dihydroxyphenylalanine2 decarboxylase Resolution 1.75 Å

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		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Query SS confidence																																																																										.	.
Query Sequence		F	Y	D	T	L	T	Q	Y	V	E	M	G	N	S	T	F	A	C	P	G	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	.	.	A	A	K	V	F	H
Query Conservation																																																																										.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.															.	.							.																						.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.															.	.							.
Template Sequence		V	M	Q	D	I	E	R	V	I	M	P	G	V	T	H	W	H	S	P	K	F	H	A	.	.	.	.	.	Y	F	P	T	A	N	S	Y	P	A	I	V	A	D	.	.	M	L	S	G	A	I	.	A	C	I	G	F	T	W	I	A	S	P	A	C	T	E	L	E	V	V	M	M	D	W	L	G	K	M	L	E
Template Known Secondary structure										T	G	G	G				T	T		T	T	B			.	.	.	.	.	S	S													.	.							.				S	S	S																						T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.															.	.							.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.						.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.			.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
		181	.	.	.	.	.											.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	K	T	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	A	T	P
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		L	P	A	E	F	L	A	C	S	G	G	K	G	G	G	V	I	Q	G	T	A	S	E	S	T	L	V	A	L	L	G	A	K	A	K	K	L	K	E	V	K	E	L	H	P	E	W	D	E	H	T	I	L	G	K	L	V	G	Y	C	S	D	Q	A	H	S	S	V	E	R	.	A	G	L	L	G	G	V	K	L
Template Known Secondary structure				G	G	G		G	G	G	T	S	S							S																										T	T	S							T	T							T	T	S							.						T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	D	.	G	T	V	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S
Query Conservation																																																									.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.																			.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Sequence		R	S	V	Q	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	R	M	R	G	A	A	L	E	K	A	I	E	Q	D	.	.	.	.	V	A	E	G	L	I	P	F	Y	A	V	V	T	L	G	T	T	N	S	C	A	F	D	Y	L	D	E	C	G	P	V	G	N	K	H	N	L	W	I	H	V	D	A
Template Known Secondary structure							B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B														.	.	.	.		T	T	T										B	S		T	T	T			B													T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.												.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.					.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F
Query Conservation
Alig confidence												.	.														.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.														.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Y	A	G	S	A	F	I	C	P	.	.	E	Y	R	H	L	M	K	G	I	E	S	A	D	.	.	.	.	S	F	N	F	N	P	H	W	M	L	V	N	F	D	C	S	A	M	W	L	K	D	P	S	W	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	R	R	F
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	G	G	G	S	G	.	.	G	G	G	G	G	G	T	T	G	G	G		S	.	.	.	.										S			S	S							S	S	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.														.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.			.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.					.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.																				.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W
Query Conservation
Alig confidence					.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	L	.	.	K	L	W	F	V	L	R	L	Y	G	V	E	N	L	Q	A	H	I	R	R	H	C	N	F	A	K	Q	F	G	D	L	C	V	A	D	S	R	F	E	L	A	A	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.																																		T	S	T	T				S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		355	.	.			.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520				.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.			.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.													.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.													.	.
Query Sequence		H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	.	.	.	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	.	.	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A
Query Conservation																																																				.	.	.													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.													.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	G	L	V	C	F	R	L	K	G	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	N	E	A	L	L	K	R	I	N	G	R	G	H	I	H	L	V	P	A	K	I	K	D	V	Y	F	L	R	M	A	I	C	S	R	F	T	Q	S	E	D	M	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	S		B							T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.											.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
		546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I	E	D	D	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	W	K	E	V	S	A	A	A	D	E	M	E	Q	E	Q
Template Known Secondary structure																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.