Job Description P21169 Confidence 99.15% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 231 Aligned Residues 312 % Identity 13% Template c3i5tB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aminotransferase prk07036 from rhodobacter2 sphaeroides kd131 Resolution 2.00 Å

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		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.			180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.									.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query SS confidence																						.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query Sequence		D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	.	.	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	.
Query Conservation																						.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Alig confidence																						.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																			.							.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		P	W	Y	M	A	T	S	P	A	A	R	L	A	E	K	I	A	T	L	T	P	G	D	L	N	R	I	F	F	T	T	G	G	S	T	A	V	D	S	A	L	R	F	S	E	F	Y	N	N	V	L	G	R	P	Q	K	K	R	I	I	V	R	Y	D	G	Y	H	G	S	T	A	L	.	T	A	A	C	T	G	R
Template Known Secondary structure		T	T	T															T	T	S	S	T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S			.				T
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.
														229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.			.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	.	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	.	.	D	G	T	V	Y	N	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.						.	.	.	.	.	.	.	.									.	.							.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	N	W	P	N	F	D	I	A	Q	D	R	I	S	F	L	S	S	P	N	P	R	H	A	G	N	R	S	Q	E	A	F	L	D	D	L	V	Q	E	F	E	D	R	I	E	S	L	G	P	D	T	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	L	A	E	P	I	L	A	S	G	G	V	I	I	P	P	A
Template Known Secondary structure		G	G	G		T	T	S					T	T									G	G	G		T	T	S																						G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	B	T	T	T	T	S	B				T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220									.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
				292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.							.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	.	.	.	.	.	.	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N
Query Conservation		.	.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																						.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.																						.	.	.
Template Sequence		G	Y	H	A	R	F	K	A	I	C	E	K	H	D	I	L	Y	I	S	D	E	V	V	T	G	F	G	R	C	G	E	W	F	A	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	F	G	V	V	P	D	.	.	.	.	I	I	T	F	A	K	G	V	T	S	G	Y	V	P	L	G	G	L	A	I	S	.	.	.
Template Known Secondary structure		T												T	T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.		T	T					S	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S									.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.									.	.	.	.	.	280	.	.					.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.										.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	V	L	A	R	I	S	G	E	N	A	K	G	S	W	F	T	N	G	Y	T	Y	S	N	Q	P	V	A	C	A	A	A	L	A	N	I	E	L	M	E	.	.	.	R	E	G	I	V	D	Q	A	R	E	M	A	D	Y	F	A	A	A	L	A	S	L	R	D	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S	G	G	G		T	T								T	T	T	T																	.	.	.		T	T																		T	T	T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Template SS confidence
												304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.				.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	A	E	T	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	L	V	G	C	V	Q	C	L	L	G	T	A	E	D	K	A	F	T	L	.	.	.	.	.	.	K	I	D	E
Template Known Secondary structure		T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T																			.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.																																											.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.							.	400	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H
Query Conservation
Alig confidence											.
Template Conservation											.
Template Sequence		R	C	F	E	L	G	L	I	V	.	R	P	L	G	D	L	C	V	I	S	P	P	L	I	I	S	R	A	Q	I	D	E	M	V	A	I	M	R	Q	A	I	T	E
Template Known Secondary structure						T	T				.				T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450