Job Description P21169 Confidence 99.16% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 230 Aligned Residues 315 % Identity 12% Template c3hmuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aminotransferase, class iii; PDBTitle: crystal structure of a class iii aminotransferase from2 silicibacter pomeroyi Resolution 2.10 Å

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		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.									.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query SS confidence																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Query Sequence		G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	.	.	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	.
Query Conservation																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Alig confidence																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																		.							.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		T	F	F	K	T	T	H	V	P	A	I	A	L	A	Q	K	L	A	E	L	A	P	G	D	L	N	H	V	F	F	A	G	G	G	S	E	A	N	D	T	N	I	R	M	V	R	T	Y	W	Q	N	K	G	Q	P	E	K	T	V	I	I	S	R	K	N	A	Y	H	G	S	T	V	.	A	S	S	A	L	G	G
Template Known Secondary structure		S	S	S	S																	S		T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S		.						S
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.
														228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.		.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																													.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																													.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	.	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	V	Y	N	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																													.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.							.	.	.	.	.	.	.	.							.								.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Sequence		M	A	G	M	H	A	Q	S	G	L	I	P	D	V	H	H	I	N	Q	P	N	W	W	A	E	G	G	D	M	D	P	E	E	F	G	L	A	R	A	R	E	L	E	E	A	I	L	E	L	G	E	N	R	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	I	A	E	P	.	V	Q	G	A	G	G	V	I	V	A
Template Known Secondary structure								T	T				S	S														T	T																							G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.						S	.	S	B	S	T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.									.	.	.	.	.	.		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
						292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																														.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																														.
Query Sequence		.	.	.	.	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	.	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R
Query Conservation		.	.	.	.																																																														.
Alig confidence		.	.	.	.																													.	.	.														.	.	.	.						.	.							.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.														.	.	.	.						.	.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	S	Y	W	P	E	I	Q	R	I	C	D	K	Y	D	I	L	L	I	A	D	E	V	I	C	G	F	G	R	T	G	.	.	.	N	W	F	G	T	Q	T	M	G	I	R	P	H	.	.	.	.	I	M	T	I	A	.	.	K	G	L	S	S	G	Y	A	P	I	G	G	S	I	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T												T	T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	S	S							T				S	.	.	.	.						.	.	G	G	G	T	T	T	S	S								.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.														.	.	.	.						.	.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.				.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.					.	.	.	.	.			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.						.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	.	.	.	.	.	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	C	D	E	V	A	H	V	I	G	K	D	E	F	N	H	G	Y	T	Y	S	G	H	P	V	A	A	A	V	A	L	E	N	L	R	I	L	E	.	.	.	E	E	N	I	L	D	H	V	R	N	V	A	A	P	Y	L	K	E	K	W	E	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.									T	T	S							T	T	T	T																	.	.	.		T	T								T											G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.				.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	S	D	F	G	V	P	A
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	H	P	L	V	G	E	A	K	I	V	G	M	M	A	S	I	A	L	T	P	N	K	A	S	R	A	K	F	A	S	E	P	G	T	I	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T	T								T	T								S		G	G	G	T			B	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																												365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I	E	D	D
Query Conservation
Alig confidence																.
Template Conservation																.
Template Sequence		Y	I	C	R	E	R	C	F	A	N	N	L	I	M	.	R	H	V	G	D	R	M	I	I	S	P	P	L	V	I	T	P	A	E	I	D	E	M	F	V	R	I	R	K	S	L	D	E	A	Q	A	E
Template Known Secondary structure											T	T	B			.				T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.