Job Description P21169 Confidence 99.31% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 224 Aligned Residues 323 % Identity 12% Template c3f6tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aspartate aminotransferase (e.c. 2.6.1.1)2 (yp_194538.1) from lactobacillus acidophilus ncfm at 2.15 a3 resolution Resolution 2.15 Å

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		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.											.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.						.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	.	.	.	.	.	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		N	N	Y	P	V	P	D	R	C	L	V	N	T	E	K	I	I	N	Y	F	L	Q	E	L	S	Y	K	D	A	N	L	A	E	Q	T	D	L	F	P	T	E	G	G	T	A	A	I	V	Y	A	F	H	S	L	A	E	N	H	L	L	K	K	G	D	K	I	A	I	N	E	P	I	F	T	P	Y	L	R	.	I
Template Known Secondary structure			S			S	S	S	S																		T	T	T				G	G	G																							T	T	S	S		T	T							S	S							T	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.		.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.								.	.	.
Query SS confidence																																																														.								.	.	.
Query Sequence		L	I	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	V	Y	.	.	.	N	A	R	Q	V	I	D	T	V
Query Conservation																																																														.								.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.												.	.							.	.	.	.	.	.	.	.							.								.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.												.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	L	K	D	Y	E	L	V	E	V	D	L	H	S	Y	E	K	N	D	W	.	.	.	.	.	.	E	I	E	P	N	E	I	E	K	L	K	.	.	D	P	S	I	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	V	V	N	P	T	N	P	T	S	K	E	F	D	T	N	A	L	N	A	I	K	Q	A	V
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	S											T	T	T	T	S	.	.	.	.	.	.											S	.	.		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.												.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.							230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240			.	.	.	.	.	.									.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.														.																																	.
Query SS confidence					.														.																																	.
Query Sequence		G	H	L	.	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	.	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	.	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R
Query Conservation					.														.																																	.
Alig confidence					.														.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	N	P	K	L	X	I	I	S	D	E	V	Y	G	A	F	V	P	N	F	K	S	I	Y	S	V	V	P	Y	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	X	L	V	Y	S	Y	S	L	F	G	C	T	G	W	R	L	G	V	I	A	L	N	E	K	N	V	F	D	D	N	I	A	H	L	D	K	V	E
Template Known Secondary structure					T	T								T	T	G	G	G	S	T	T								S	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S		G	G	G									S	S									T	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.											.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		L	R	Q	L	H	K	R	Y	S	S	V	V	L	D	P	D	K	X	K	F	I	D	R	L	C	A	D	S	R	S	I	G	L	Y	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	I	X	E	A	L	F	S	X	T	H	L	L	T	S	T	N	G	G	S	.	D	D	P	Y	I	D	I	A	R	K	L	V	S	E	R	Y
Template Known Secondary structure											T	T		S		G	G	G												T	T	T	T	T	G	G	G		S																		T	T		B	G	G	G	T	.	B
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	L	H	D	A	X	Q	A	P	K	D	E	T	D	T	N	T	H	Y	Y	S	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	Y	R
Template Known Secondary structure									T						S	T	T	B			S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	450
		505																.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.		.	.	.	520	.	.	.				.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.								.	.	.																	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.								.	.	.																	.
Query Sequence		F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	.	R	E	N	G	I	V	P	.	.	.	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	.	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I	E	D	D
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.								.	.	.																	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.								.	.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	E	K	I	Y	G	K	E	F	R	D	Y	L	T	N	N	F	E	Q	V	D	F	L	L	K	L	A	E	K	N	G	V	V	L	V	D	G	V	G	F	G	A	K	P	G	E	L	R	V	S	Q	A	N	L	P	T	E	D	Y	A	L	I	G	K	Q	V	L	E	L	L	K	E	Y	Y	E	E
Template Known Secondary structure																																T	T	S	S	S		T	T					S	S	T	T						S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.