Job Description P21169 Confidence 99.32% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 223 Aligned Residues 374 % Identity 13% Template c3eleB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:amino transferase; PDBTitle: crystal structure of amino transferase (rer070207001803) from2 eubacterium rectale at 2.10 a resolution Resolution 2.10 Å

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		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		C	Q	Y	E	E	N	L	L	P	P	F	Y	D	T	L	T	Q	Y	V	E	M	G	N	S	T	F	A	C	P	G	.	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A
Query Conservation																																.
Alig confidence																																.																															.
Template Conservation																																																															.
Template Sequence		S	X	Y	Q	L	G	S	V	R	S	A	I	R	E	L	F	E	Y	G	K	K	R	A	A	I	V	G	K	E	N	V	Y	D	F	S	I	G	N	P	S	I	P	A	P	Q	I	V	N	D	T	I	K	E	L	V	T	D	Y	D	S	V	.	A	L	H	G	Y	T	S	A	Q	G	D	V	E	T	R	A	A	I
Template Known Secondary structure									S																				G	G	G											S																	S				.				S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.				.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.		.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																					.
Query SS confidence															.	.	.																					.
Query Sequence		Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	.	.	.	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	.	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I
Query Conservation															.	.	.																					.
Alig confidence															.	.	.																					.																		.																						.	.	.	.
Template Conservation																																																								.																						.	.	.	.
Template Sequence		A	E	F	L	N	N	T	H	G	T	H	F	N	A	D	N	L	Y	X	T	X	G	A	A	A	S	L	S	I	C	F	R	A	L	T	S	D	A	Y	D	E	F	I	T	I	A	P	Y	F	P	E	Y	K	V	.	F	V	N	A	A	G	A	R	L	V	E	V	P	A	D	T	E	H	F	Q	I	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															G	G	G					S	S															S	T	T							S	S			T	T				.					T	T										T	T	T	S	S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.																						.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.				.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.							.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.									.	.	.													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.									.	.	.													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	V	Y	N	.	.	.	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	.	.	.	.	.	.	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q
Query Conservation																																						.									.	.	.													.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.									.	.	.													.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	D	F	D	A	L	E	E	R	I	N	A	H	T	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	I	N	S	P	N	N	P	S	G	T	V	Y	S	E	E	T	I	K	K	L	S	D	L	L	E	K	K	S	K	E	I	G	R	P	I	F	I	I	A	D	E	P	Y	R	.	E	I	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.								T			T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		T	T	T																								T	S									T	T	T	.	T		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Template SS confidence
							160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.											.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350		.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	.	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A
Query Conservation																																			.
Alig confidence					.	.														.	.	.	.												.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.														.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	G	.	.	I	K	V	P	F	V	T	K	Y	Y	D	N	T	.	.	.	.	L	V	C	Y	S	Y	S	K	S	L	S	L	P	G	E	R	I	G	Y	V	L	V	P	D	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	K	A	E	L	Y	A	A	V	C	G	A	G	R	A	L	G	Y	V	C	A	P
Template Known Secondary structure			T	T	.	.						G	G	G	T		S	S		.	.	.	.						S	T	T	T	S	S		G	G	G									T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T															T	T				S
Template Predicted Secondary structure					.	.														.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.			.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.					240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.										.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	F	Q	K	X	I	V	K	C	Q	G	A	T	G	D	I	N	A	Y	K	E	N	R	D	L	L	Y	E	G	L	T	R	I	G	Y	H	C	F	K	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T		T	T																							T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.			.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	.	.	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	A	F	Y	X	F	V	K	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	D	S	N	A	F	C	E	K	A	K	E	E	D	V	L	I	V	A	A	D	G	F	G	C	P	G	W	V	R	I	S	Y	C	V	D	R	E	X	I	K	H	S	X	P	A	F	E	K	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	B	S	S							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S												T	T						G	G	G	G	T		T	T								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									331	.	.	.	.	.	.	.	.	340													.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		555	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	H	I	E	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	K	Y	N	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.