Job Description P21169 Confidence 99.52% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 200 Aligned Residues 338 % Identity 13% Template c3a8uX_ PDB info PDB header:transferase Chain: X: PDB Molecule:omega-amino acid--pyruvate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of omega-amino acid:pyruvate aminotransferase Resolution 1.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.			180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		G	H	Q	H	G	A	F	F	K	K	H	P	A	G	R	H	F	Y	D	F	F	G	E	N	V	F	R	A	D	M	C	N	A	D	V	K	L	G	D	L	L	I	H	E	G	S	A	K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	.	.	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.						.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.						.	.	.	.	.
Template Sequence		G	H	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	I	Q	E	A	V	A	K	Q	L	S	T	L	D	Y	S	.	P	G	F	Q	Y	.	.	.	.	.	G	H	P	L	S	F	Q	L	A	E	K	I	T	D	L	T	P	G	N	L	N	H	V	F	F	T	D	S	G	S	E	C	A	L	T	A	V	K
Template Known Secondary structure			B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	T		S			.		S	S	S		.	.	.	.	.														T	T	S	S	T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		65	.	.	.											.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.		.	.	.	.	90						.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		200	.	.									.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.												.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.																				.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		M	V	R	A	Y	W	R	L	K	G	Q	A	T	K	T	K	M	I	G	R	A	R	G	Y	H	G	V	N	I	A	.	G	T	S	L	G	G	V	N	G	N	R	K	L	F	G	Q	P	M	Q	D	V	D	H	L	P	H	T	L	L	A	S	N	A	Y	S	R	G	M	P	K	E	G	G	I	A	L	A	D	E
Template Known Secondary structure										T	T		T	T								T	T					S	S			.												T	T	T				S		S										G	G	G	T	T		S	S	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		261	.	.						.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.			.	.	.	.	290	.					.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.																							.	.							.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.																							.	.							.	.	.	.
Query Sequence		I	R	D	.	.	.	.	.	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	Y	.	.	D	G	T	V	Y	N	.	.	.	.	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L
Query Conservation					.	.	.	.	.																							.	.							.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.									.	.							.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Template Sequence		L	L	K	L	I	E	L	H	D	A	S	N	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	F	V	E	P	L	A	G	S	A	G	V	L	V	P	P	E	G	Y	L	K	R	N	R	E	I	C	N	Q	H	N	I	L	L	V	F	D	E	V	I	T	G	F	G	R	T	G	.	.	.	S	M	F	G	A	D	S
Template Known Secondary structure											G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	B	T	T	T	T		B				T	T													T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.									.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.													.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y	P	L	F	A	A	L
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	V	T	P	D	.	.	.	.	L	M	C	I	A	K	Q	V	T	N	G	A	I	P	M	G	A	V	I	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	I	Y	Q	T	F	M	N	Q	P	T	P	E	Y	A	V	E	F	P	H	G	Y	T	Y	S	A	H	P	V	A	C	A	A	G
Template Known Secondary structure			T				S	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T		S	S		T	T	S		S	S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.					.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.															.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	A	A	L	C	L	L	Q	.	.	.	K	E	N	L	V	Q	S	V	A	E	V	A	P	H	F	E	K	A	L	H	G	I	K	G	A	K	N	V	I	D	I	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.		T	T																		T	T	T	T	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.				.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	F	G	L	A	G	A	I	Q	I	A	P	R	D	.	.	.	.	.	.	G	D	A	I	V	R	P	F	E	A	G	M	A	L	W	K	A	G	F	Y	V	.	R	F	G	G	D	T	L	Q	F	G	P	T	F	N	S	K	P	Q	D	L	D	R	L	F	D	A	V	G	E	V	L	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		T	T									B	T	.	.	.	.	.	.	T	B	S	S														T				.				T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.																						.
Template SS confidence
								380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.							.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.