Job Description P21169 Confidence 99.26% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 225 Aligned Residues 325 % Identity 16% Template c2zy3A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:l-aspartate beta-decarboxylase; PDBTitle: dodecameric l-aspartate beta-decarboxylase Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.							.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.						.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.			.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																									.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																									.	.
Query Sequence		K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	.	.	.	.	.	.	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	.	.	.	.	.	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	.	.	A	G	A	T	P	V	Y	L	E
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																									.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																				.					.	.
Template Conservation																																																																		.
Template Sequence		K	I	V	R	Q	Y	I	I	R	E	M	G	A	D	A	I	P	S	E	S	V	N	L	F	A	V	E	G	G	T	A	A	M	A	Y	I	F	E	S	L	K	L	N	G	L	L	K	A	G	D	K	V	A	I	G	M	P	V	F	T	P	Y	I	E	.	I	P	E	L	A	Q	Y	A	L	E	E	V	A	I	N
Template Known Secondary structure												T	T		T	T	S		G	G	G							S																T	T	S	S		T	T								S			T					.	S	T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.				290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.							.	.	.															.	.
Query SS confidence																																																		.							.	.	.															.	.
Query Sequence		A	S	R	N	P	F	G	F	I	G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	.	T	Y	D	G	T	V	.	.	.	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	.	.	D	Y	I	L	F	D
Query Conservation																																																		.							.	.	.															.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.										.	.							.	.	.	.	.	.	.	.							.							.	.	.															.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.										.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	P	S	L	N	W	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	S	E	L	D	K	L	K	.	.	D	P	A	I	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	F	F	C	V	N	P	S	N	P	P	S	V	K	M	D	Q	R	S	L	E	R	V	R	N	I	V	A	E	H	R	P	D	L	M	I	L	T	D
Template Known Secondary structure			B	G	G	G	T	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G	.	.		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		S	S	S		B																	T		T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.										.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.									.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.									.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.			350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.
Query SS confidence																																										.	.
Query Sequence		S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A	D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	.	.	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T
Query Conservation																																										.	.
Alig confidence						.						.	.	.	.													.	.	.	.											.	.
Template Conservation						.						.	.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		D	V	Y	G	.	T	F	A	D	D	.	.	.	.	F	Q	S	L	F	A	I	C	P	E	N	T	.	.	.	.	L	L	V	Y	S	F	S	K	Y	F	G	A	T	G	W	R	L	G	V	V	A	A	H	Q	Q	N	V	F	D	L	A	L	D	K	L	Q	E	S	E	K	V	A	L	D	H	R	Y	R	S	L
Template Known Secondary structure			T	T	G	.	G	G	S	S	S	.	.	.	.									G	G	G		.	.	.	.						S	T	T	T	T	T		G	G	G									S	S									S	S												T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure						.						.	.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290		.	.	.	.	.					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.					.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		388	.																											390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Y	P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	D	V	R	S	L	K	F	I	D	R	L	V	A	D	S	R	A	V	A	L	N	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	V	Q	M	A	L	F	S	L	F	A	L	M	D	E	A	D	E	Y	K	H	T	L	K	Q	L	I	R	R	R	E	T	T	L	Y	R	E	L	G	M	P	P	L	R	D	E	N	A
Template Known Secondary structure			S		G	G	G											T	T	T	T	T	T	G	G	G		S	S																			T	T																			T	T	T	T	T	S						T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H	G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	Y	Y	T	L	I	D	L	Q	D	V	T	A	K	L	Y	G	E	A	F	S	E	W	A	V	K	Q	S	S	T	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	F	R	I	A	D	E	T	G	I
Template Known Secondary structure				S																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
		522	.	.	.						.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	E	K	.	.	.	.	.	C	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A	Q	F	E	Q	H	I
Query Conservation						.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.												.
Template Conservation																						.
Template Sequence		V	L	L	P	G	R	G	F	G	S	N	R	P	S	G	R	A	S	L	A	.	N	L	N	E	Y	E	Y	A	A	I	G	R	A	L	R	K	M	A	D	E	L
Template Known Secondary structure								S	S		T	T	S							S	S	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.