Job Description P21169 Confidence 99.82% Date Thu Jan 5 11:37:54 GMT 2012 Rank 71 Aligned Residues 285 % Identity 18% Template c2cb1A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:o-acetyl homoserine sulfhydrylase; PDBTitle: crystal structure of o-actetyl homoserine sulfhydrylase2 from thermus thermophilus hb8,oah2. Resolution 2.0 Å

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		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.					.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.
Query Sequence		K	D	A	Q	K	F	A	A	K	V	F	H	A	D	K	T	Y	F	V	L	N	G	T	S	A	A	N	K	V	V	T	N	A	L	L	T	R	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	K	S	N	H	H	G	A	L	I	Q	.	.	.	.	A	G	A	T	P	V	Y	L	E	A	S	R	N	P	F	G	F	I
Query Conservation																																																												.	.	.	.
Alig confidence																								.																															.					.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	L	E	E	R	L	K	A	L	E	G	A	L	E	A	V	V	L	A	S	G	.	Q	A	A	T	F	A	A	L	L	A	L	L	R	P	G	D	E	V	V	A	A	K	G	L	F	G	Q	T	I	G	.	L	F	G	Q	V	L	S	L	M	G	V	T	V	R	Y	V	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T		S						S	S		.										T	T			T	T							T	T								.					T	T	T	T	T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110		.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.
Query SS confidence																																										.
Query Sequence		G	G	I	D	A	H	C	F	N	E	E	Y	L	R	Q	Q	I	R	D	V	A	P	E	K	A	D	L	P	R	P	Y	R	L	A	I	I	Q	L	G	T	.	Y	D	G	T	V	Y	N	A	R	Q	V	I	D	T	V	G	H	L	C	D	Y	I	L	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	A
Query Conservation																																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	E	A	V	R	E	A	L	S	A	K	T	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	V	E	T	V	A	N	P	A	L	L	V	P	D	L	E	A	L	A	T	L	A	E	E	A	G	V	A	L	V	V	D	N	T	F	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S										T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		T	T	T																	T								G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.											.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.									.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370													.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	S	P	L	L	L	E	L	N	E	N	D	P	G	I	F	V	T	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	N	H	I	R	G	Q	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	C	P	H	K	R	L	N	N	A	F	M	L	H	A	S	T	S	P	F	Y
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.
Template Sequence		G	A	L	C	R	P	L	A	W	G	A	H	.	.	.	.	V	V	V	E	S	L	T	W	A	S	G	H	G	S	V	L	G	G	A	V	L	S	R	E	T	E	L	W	R	N	Y	P	Q	F	L	Q	P	W	E	A	L	R	A	R	C	F	P	E	R	V	R	T	L	G	L	S	L	C	G	M	A	L	S	P
Template Known Secondary structure		T	T	S			G	G	G	G	T		S	.	.	.	.										S		S	S													S	G	G	G	G	S	G	G	G	G							G	G	G											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.					.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	F	A	A	L	D	V	N	A	K	I	H	E	G	E	S	G	R	R	L	W	A	E	C	V	E	I	G	I	E	A	R	K	A	I	L	A	R	C	K	L	F	R	P	F	I	P	P	V	V	D	G	K	L	W	Q	D	Y	P	T	S	V	L	A	S	D	R	R	F	F	S	F	E	P	G	A	K	W	H
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	A	Y	L	L	F	Q	G	L	E	T	V	A	L	R	.	.	.	.	.	V	A	R	M	S	E	T	A	R	F	L	A	E	R	L	Q	G	H	P	K	V	K	A	L	R	Y	P	G	L	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											G	G	G					.	.	.	.	.																	T		T	T		S					T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.						.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.														.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	E	G	Y	A	A	D	Q	Y	F	V	D	P	C	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	L	T	T	P	G	I	D	A	E	T	G	E	Y	S	D	F	G	V	P	A	T	I	L	A	H	Y	L	R	E	N	G	I	V	P	E	K	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	A	H	R	N	A	R	K	Y	L	A	S	G	G	P	I	L	T	L	D	L	G	D	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	S	R	F	L	G	A	I	R	L	L	K	A	A	N	L	G	D	A	R	T	L	L	V	H	P	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T									S	S	S		S							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S				S			S		S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.															340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
																			527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	N	S	I	L	F	L	L	T	P	A	E	S	H	E	K	L	A	Q	L	V	A	M	L	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	T	H	S	R	L	K	E	E	A	R	L	Q	A	G	V	T	P	G	L	V	R	V	S	V	G	L	E	D	P	L	D	L	L	A	L	F	E	E	A	L	E
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T	S								T	T			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410

No model constructed - rank, confidence too low