Job Description P37689 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:01 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 348 % Identity 20% Template c3iddA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:2,3-bisphosphoglycerate-independent PDBTitle: cofactor-independent phosphoglycerate mutase from2 thermoplasma acidophilum dsm 1728 Resolution 2.80 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.				.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		K	P	M	V	L	V	I	L	D	G	Y	G	Y	R	E	E	Q	Q	.	.	.	D	N	A	I	F	S	A	K	T	P	V	M	D	A	L	W	A	N	R	P	H	T	L	I	D	A	S	G	L	E	V	G	L	P	D	R	Q	M	G	N	S	E	V	G	H	V	N	L	G	A	G	R	I	V	Y	Q	D	L	T
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																											.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	I	I	L	I	V	L	D	G	L	G	D	R	P	G	S	D	L	Q	N	R	T	P	L	Q	A	A	F	R	P	N	L	N	W	L	A	S	H	G	I	N	G	I	X	H	P	.	.	.	.	.	.	I	S	P	.	.	.	.	.	S	D	T	S	H	X	S	L	.	.	.	.	.	L	G	Y	D	P	K
Template Known Secondary structure											S				S		B	G	G	G	T	S	B						S											T	S								.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.				S					.	.	.	.	.	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.							50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	D	V	E	I	K	D	R	A	F	F	A	N	P	V	L	T	G	A	V	D	K	A	K	N	A	G	K	A	V	H	I	M	G	L	L	S	A	G	G	V	H	S	H	E	D	H	I	M	A	M	V	E	L	A	A	E	R	G	A	E	K	I	Y	L	H	A	F	L	D	G	R	D	T	P	P	R	S	A
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	P	G	R	G	P	F	E	A	L	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	X	D	I	R	P	G	D	L	A	F	R	A	N	F	A	T	N	R	D	G	.	.	.	.	.	.	V	I	V	D	R	R	A	G	R	E	N	K	G
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T												T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T					T	T													T	T	.	.	.	.	.	.					T	T	G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72										.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.							.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	S	L	K	K	F	E	E	K	F	A	A	L	G	K	G	R	V	A	S	I	I	G	R	Y	Y	A	M	D	R	D	N	R	W	D	R	V	E	K	A	Y	D	L	L	T	L	A	Q	G	E	F	Q	A	D	T	A	V	A	G	L	Q	A	A	Y	A	R	D	E	N	D	E	F	V	K	A	T	V	I	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.														.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.														.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	E	E	L	A	D	A	I	S	L	D	X	G	E	Y	S	F	R	V	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	E	H	R	A	A	L	V	V	S	G	P	D	L	S	D	X	I	G	D	S	D	P	.	.	.	.	H	R	E	G	L	P	P	E	K	I	R	P	T	.	.	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.								T					S	S								.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T									S	S					B			S			.	.	.	.	S	S	T	T	S							B	S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
									120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140									.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.					.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.			.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	G	Q	P	D	A	A	M	E	D	G	D	A	L	I	F	M	N	F	R	A	D	R	A	R	E	I	T	R	A	F	V	N	A	D	F	D	G	F	A	R	K	K	V	V	N	V	D	F	V	M	L	T	E	Y	A	A	D	I	K	T	A	V	A	Y	P	P	A	S	L	V	N	T	F	G	E	W	M	A
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	G	D	R	T	A	E	V	X	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	L	E	E	A	R	R	I	L	S	D	H	R	V	N	K	E	R	V	K	N	G	R	L	P	G	N	E	L	L	V	R	S	A	G	K	V	P	A	I	P	S	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Template Known Secondary structure		G	G	G									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S								T	T	T																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.												190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.													.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	D	K	T	Q	L	R	I	S	E	T	E	K	Y	A	H	V	T	F	F	F	N	G	G	V	E	E	S	F	K	G	E	D	R	I	L	I	N	S	P	K	V	A	T	Y	D	L	Q	P	E	M	S	S	A	E	L	T	E	K	L	V	A	A	I	K	S	G	K	Y	D	T	I	I	C	N	Y	P	N	G
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.											.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.											.	.
Template Sequence		K	N	R	X	K	G	A	C	V	V	G	S	P	W	L	K	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	R	L	L	R	X	D	V	F	D	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	Y	R	G	K	I	E	K	A	V	D	L	T	S	.	.	S	H	D	F	V	L	V	N	I	K	.	.
Template Known Secondary structure				S	S								S							.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													G	G	G	.	.	T		S								.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.											.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.										.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.													.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		D	M	V	G	H	T	G	V	M	E	A	A	V	K	A	V	E	A	L	D	H	C	V	E	E	V	A	K	A	V	E	S	V	G	G	Q	L	L	I	T	A	D	H	G	N	A	E	Q	M	R	D	P	A	T	G	Q	A	H	T	A	H	T	N	L	P	V	P	L	I	Y	V	G	D	K	N	V	K	A	V	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	Y	P	L	K	R	D	V	I	E	D	I	D	R	A	X	E	P	L	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	I	C	V	T	G	D	H	S	.	D	P	V	P	I	V	F	Y	T	D	G	V	X	N	D	G	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																T	T	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.										T	T					S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
									307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.												.	.	330	.										.	.	.	.	.	.	.	.	340	.		.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
										482	.	.	.	.					.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	G	K	L	.	.	.	.	S	D	I	A	P	T	M	L	S	L	M	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	F	D	E	L	S	S	A	S	G	S	L	R	I	T	S	Y	N	V	X	D	I	L	X	Q	L	A	G
Template Known Secondary structure					S	T	T	G	G	G	G	S	S					G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.