Job Description P37689 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:01 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 357 % Identity 21% Template c2zktB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate PDBTitle: structure of ph0037 protein from pyrococcus horikoshii Resolution 2.40 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.				.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		K	K	P	M	V	L	V	I	L	D	G	Y	G	.	.	.	Y	R	E	E	Q	Q	D	N	A	I	F	S	A	K	T	P	V	M	D	A	L	W	A	N	R	P	H	T	L	I	D	A	S	G	L	E	V	G	L	P	D	R	Q	M	G	N	S	E	V	G	H	V	N	L	G	A	G	R	I	V	Y	Q	D	L
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	K	G	L	L	I	I	L	D	G	L	G	D	R	P	I	K	E	L	N	G	L	T	P	L	E	Y	A	N	T	P	N	M	D	K	L	A	E	I	G	I	L	G	Q	Q	D	P	.	.	.	.	.	.	I	K	P	G	Q	P	A	G	S	D	T	A	H	L	S	I	.	.	.	.	.	F	G	Y	D	P
Template Known Secondary structure											T	T	B	B				B	G	G	G	T	T	B						S												S							S	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T													.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.							.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.						.	.	70	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	L	D	V	E	I	K	D	R	A	F	F	A	N	P	V	L	T	G	A	V	D	K	A	K	N	A	G	K	A	V	H	I	M	G	L	L	S	A	G	G	V	H	S	H	E	D	H	I	M	A	M	V	E	L	A	A	E	R	G	A	E	K	I	Y	L	H	A	F	L	D	G	R	D	T	P	P	R	S
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	Y	R	G	R	G	F	F	E	A	L	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	L	S	K	D	D	L	A	F	R	V	N	F	A	T	L	E	N	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.						S								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T					T	T																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		73										.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	110
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	S	S	L	K	K	F	E	E	K	F	A	A	L	G	K	G	R	V	A	S	I	I	G	R	Y	Y	A	M	D	R	D	N	R	W	D	R	V	E	K	A	Y	D	L	L	T	L	A	Q	G	E	F	Q	A	D	T	A	V	A	G	L	Q	A	A	Y	A	R	D	E	N	D	E	F	V	K	A	T	V	I
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Q	E	E	V	D	I	G	V	D	F	I	F	K	T	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	V	L	V	L	K	G	M	S	R	G	Y	K	V	G	D	N	D	P	H	E	A	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	S	K	K
Template Known Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S								S	T	T							T	T		G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.										.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.		.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		R	A	E	G	Q	P	D	A	A	M	E	D	G	D	A	L	I	F	M	N	F	R	A	D	R	A	R	E	I	T	R	A	F	V	N	A	D	F	D	G	F	A	R	K	K	V	V	N	V	D	F	V	M	L	T	E	Y	A	A	D	I	K	.	T	A	V	A	Y	P	P	A	S	L	V	N	T	F	G	E	W
Query Conservation																																																																.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	E	E	F	V	K	K	A	Q	E	V	L	E	K	H	P	I	N	E	R	R	R	K	E	G	K	P	I	A	N	Y	L	L	I	R	G	A	G	T	Y	P	N	I	P	M	K	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S									T	T															S				S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		188	.	190																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	K	N	D	K	T	Q	L	R	I	S	E	T	E	K	Y	A	H	V	T	F	F	F	N	G	G	V	E	E	S	F	K	G	E	D	R	I	L	I	N	S	P	K	V	A	T	Y	D	L	Q	P	E	M	S	S	A	E	L	T	E	K	L	V	A	A	I	K	S	G	K	Y	D	T	I	I	C	N	Y	P
Query Conservation
Alig confidence		.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Conservation		.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Sequence		.	E	Q	W	K	V	K	A	A	G	V	I	A	V	A	L	V	K	G	V	A	R	A	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	V	Y	T	P	E	G	A	T	G	E	Y	N	T	N	E	M	A	K	A	K	K	A	V	E	L	L	K	.	.	D	Y	D	F	V	F	L	H	F	K
Template Known Secondary structure		.				T									S										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T			S	S	T	T															T	.	.	T		S
Template Predicted Secondary structure		.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template SS confidence
			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.															.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.			.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	D	M	V	G	H	T	G	V	M	E	A	A	V	K	A	V	E	A	L	D	H	C	V	E	E	V	A	K	A	V	E	S	V	G	G	Q	L	L	I	T	A	D	H	G	N	A	E	Q	M	R	D	P	A	T	G	Q	A	H	T	A	H	T	N	L	P	V	P	L	I	Y	V	G	D	K	N	V	K	A
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	D	A	A	G	H	D	N	K	P	K	L	K	A	E	L	I	E	R	A	D	R	M	I	G	Y	I	L	D	H	V	D	L	E	E	V	V	I	A	I	T	G	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	P	C	E	V	M	N	H	S	G	D	P	V	P	L	L	I	A	G	G	G	V	R	T	D
Template Known Secondary structure									T	T																					T	T			T	T	T								S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B			T	T	T	T	S		B										S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.										.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		481	.	.															.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	L	S	D	I	A	P	T	M	L	S	L	M	G	M	E	I
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	T	K	R	F	G	E	R	E	A	M	K	G	G	L	G	R	I	R	G	H	D	I	V	P	I	M	M	D	L	M	N	R	S	E
Template Known Secondary structure		S			S		S					T	T		T	T					G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.