Job Description P37689 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:57:01 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 364 % Identity 18% Template c2i09A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:phosphopentomutase; PDBTitle: crystal structure of putative phosphopentomutase from streptococcus2 mutans Resolution 2.00 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.						.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	K	P	M	V	L	V	I	L	D	G	Y	G	Y	R	E	E	Q	Q	D	.	.	.	.	.	N	A	I	F	S	A	K	T	P	V	M	D	A	L	W	A	N	R	P	H	T	L	I	D	A	S	G	L	E	V	G	L	P	D	R	Q	M	G	N	S	E	V	G	H	V	N	L	G	A	G	R	I	V	Y
Query Conservation																							.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	N	R	I	H	L	V	V	L	D	S	V	G	I	G	A	A	P	D	A	N	N	F	S	N	A	G	V	P	D	G	A	S	D	T	L	G	H	I	S	K	T	V	G	L	N	V	P	N	M	A	K	I	G	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	P	R	D	T	P	L	.	.	.	.	.	K	T
Template Known Secondary structure				S								T	T				S	B		T	T	G	G	G	S			T	T			G	G	G											T											T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S			S	S			.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.									60	.	.	.	.	.	.	.						.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	D	L	T	R	L	D	V	E	I	K	D	R	A	F	F	A	N	P	V	L	T	G	A	V	D	K	A	K	N	A	G	K	A	V	H	I	M	G	L	L	S	A	G	G	V	H	S	H	E	D	H	I	M	A	M	V	E	L	A	A	E	R	G	A	E	K	I	Y	L	H	A	F	L	D	G	R	D	T	P
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	P	A	E	N	H	P	T	G	Y	V	T	K	L	E	E	V	S	L	G	K	D	T	M	T	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	I	M	G	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	E	P	F	D
Template Known Secondary structure						S	S		S	S									S	S			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T			.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	100	.	.	.									.	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	R	S	A	E	S	S	L	K	K	F	E	E	K	F	A	A	L	G	K	G	R	V	A	S	I	I	G	R	Y	Y	A	M	D	R	D	N	R	W	D	R	V	E	K	A	Y	D	L	L	T	L	A	Q	G	E	F	Q	A	D	T	A	V	A	G	L	Q	A	A	Y	A	R	D	E	N	D	E	F	V	K	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Sequence		T	F	W	N	G	F	P	E	E	I	I	S	K	I	E	K	F	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	V	I	R	E	A	N	K	P	Y	S	G	T	G	E	L	I	.	.	.	.	I	Y	T	S	A	D	P	V	L	Q	I	A	A
Template Known Secondary structure				T	T															S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			B		G	G	G		S	B							B		.	.	.	.					S	S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template SS confidence
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	I	R	A	E	G	Q	P	D	A	A	M	E	D	G	D	A	L	I	F	M	N	F	R	A	D	R	A	R	E	I	T	R	A	F	V	N	A	D	F	D	G	F	A	R	K	K	V	V	N	V	D	F	V	M	L	T	E	Y	A	A	D	I	K	T	A	V	A	Y	P	P	A	S	L	V	N	T	F	G
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	E	D	V	I	P	L	D	E	L	Y	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	E	Y	A	R	S	I	.	.	.	T	L	E	R	P	A	L	L	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	A	R	P	T	A	N	R	H	D	Y	A	L	S	P	F	A	P	T	V	L
Template Known Secondary structure			T	T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.		S	S	T	T	S			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.													.	.	.	.	190	.	.				.	.	.	.	.	.	.	200	.	.														.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		E	W	M	A	K	N	D	K	T	Q	L	R	I	S	E	T	E	K	Y	A	H	V	T	F	F	F	N	G	G	V	E	E	S	F	K	G	E	D	R	I	L	I	N	S	P	K	V	A	T	Y	D	L	Q	P	E	M	S	S	A	E	L	T	E	K	L	V	A	A	I	K	S	G	K	.	.	Y	D	T	I	I
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	K	L	A	D	A	G	V	S	T	Y	A	V	G	K	I	N	D	I	F	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	I	T	N	D	M	G	H	N	K	S	N	S	H	G	V	D	T	L	I	K	T	M	G	L	S	A	F	T	K	G	F	S	F
Template Known Secondary structure							T	T							T	T					T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S							S	S															S	S			S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
		397	.	.	400	.	.	.	.		.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		C	N	Y	P	N	G	D	M	.	V	G	H	T	G	V	M	E	A	A	V	K	A	V	E	A	L	D	H	C	V	E	E	V	A	K	A	V	E	S	V	G	G	Q	L	L	I	T	A	D	H	G	N	A	E	Q	M	R	D	P	A	T	G	Q	A	H	T	A	H	T	N	L	P	V	P	L	I	Y	V	G	D
Query Conservation										.
Alig confidence										.																														.														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	L	V	D	F	D	A	L	Y	G	H	R	R	N	A	H	G	Y	R	D	C	L	H	E	F	D	E	R	L	P	E	I	I	A	A	M	K	.	V	D	D	L	L	L	I	T	A	D	H	G	N	.	.	.	.	.	.	.	D	P	T	Y	A	G	T	D	H	T	R	E	Y	V	P	L	L	A	Y	S	P
Template Known Secondary structure											T	T	T	T	T																						T			.	T	T								S	S	B		.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	S	S	S		B		B									T
Template Predicted Secondary structure																																								.														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		476	.	.			.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure					.	.
Query SS confidence					.	.
Query Sequence		K	N	V	.	.	K	A	V	E	G	G	K	L	S	D	I	A	P	T	M	L	S	L	M	G	M	E	I	P	Q	E	M	T	G	K	P	L	F
Query Conservation					.	.
Alig confidence					.	.																									.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		S	F	T	G	N	G	V	L	P	V	G	H	Y	A	D	I	S	A	T	I	A	D	N	F	G	V	D	T	A	.	.	M	I	G	E	S	F	L
Template Known Secondary structure		T		S										T	T										T	T					.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.			.	.	.	.	.	.	.