Job Description P77318 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:27:41 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 422 % Identity 27% Template c3ed4A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:arylsulfatase; PDBTitle: crystal structure of putative arylsulfatase from escherichia coli Resolution 1.70 Å

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		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	P	N	I	I	V	L	T	M	D	D	L	G	Y	G	Q	L	P	F	D	K	G	S	F	D	P	K	T	M	E	N	R	E	V	V	D	T	Y	K	I	G	I	D	K	A	I	E	A	A	Q	K	S	T	P	T	L	L	S	L	M	D	E	G	V	R	F	T	N	G	Y	V	A	H	G	V	S	G	P	S	R
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	P	N	L	V	I	I	M	A	D	D	L	G	Y	G	D	L	A	T	Y	G	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	K	T	P	N	I	D	R	L	A	Q	E	G	V	K	F	T	D	Y	Y	A	P	A	P	L	S	S	P	S	R
Template Known Secondary structure											S	S			T	T	S	S	G	G	G	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												T	S				S	S				S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.
Query SS confidence																						.	.
Query Sequence		A	A	I	M	T	G	R	A	P	A	R	F	G	V	Y	S	N	T	D	A	.	.	Q	D	G	I	P	L	T	E	T	F	L	P	E	L	F	Q	N	H	G	Y	Y	T	A	A	V	G	K	W	H	L	S	K	I	S	N	V	P	V	P	E	D	K	Q	T	R	D	Y	H	D	N	F	T	T	F	S	A	E	E
Query Conservation																						.	.
Alig confidence																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	L	L	T	G	R	M	P	F	R	T	G	I	R	S	W	I	P	S	G	K	D	V	A	L	G	R	N	E	L	T	I	A	N	L	L	K	A	Q	G	Y	D	T	A	M	M	G	K	L	H	L	N	A	G	G	D	R	T	D	Q	P	Q	A	Q	D	M	G	F	D	Y	S	L	A	N	T	A	G	F	V
Template Known Secondary structure							T	S		G	G	G	G	T		S	S				T	T	S	S			S		T	T										T	T	T											S	S	S		T	T		T	T	S			T	T	T	T	T		S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		W	Q	P	Q	N	R	G	F	D	Y	F	M	G	F	H	A	A	G	T	A	Y	Y	N	S	P	S	L	F	K	N	R	E	R	V	P	A	K	G	Y	I	S	D	Q	L	T	D	E	A	I	G	V	V	D	R	A	K	T	L	D	Q	P	F	M	L	Y	L	A	Y	N	A	P	H	L	P	N	D	N	P	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence											.	.	.	.																																										.																								.	.
Template Conservation											.	.	.	.																																										.
Template Sequence		T	D	A	T	L	D	N	A	K	.	.	.	.	E	R	P	R	Y	G	M	V	Y	P	T	G	W	L	R	N	G	Q	P	T	P	R	A	D	K	M	S	G	E	Y	V	S	S	E	V	V	N	W	L	D	N	.	K	K	D	S	K	P	F	F	L	Y	V	A	F	T	E	V	H	S	P	L	A	S	P	K	K
Template Known Secondary structure								T			.	.	.	.	S	S	S		B							S				T	T							S	S																T	.			S	S											T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.					.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.		.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
																		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	D	Q	Y	Q	K	Q	F	N	T	G	S	Q	T	A	D	N	Y	Y	A	S	V	Y	S	V	D	Q	G	V	K	R	I	L	E	Q	L	K	K	N	G	Q	Y	D	N	T	I	I	L	F	T	S	D	N	G	A	V	I	D	G	P	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	D	M	Y	S	Q	Y	M	S	A	Y	Q	K	Q	H	P	D	L	F	Y	G	D	W	A	D	K	P	W	R	G	V	G	E	Y	Y	A	N	I	S	Y	L	D	A	Q	V	G	K	V	L	D	K	I	K	A	M	G	E	E	D	N	T	I	V	I	F	T	S	D	N	G	P	V	T	R	E	A	R	K	V
Template Known Secondary structure					T	T	G	G	G	B							S	T	T	B		G	G	G		T	T	S				B	S																								T	T		G	G	G								S	S					S				S	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
							354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.		.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																				.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																				.
Query Sequence		.	.	.	.	.	L	P	L	N	G	A	Q	K	G	Y	K	S	Q	T	Y	P	G	G	T	H	T	P	M	F	M	W	W	K	G	K	L	Q	P	G	N	.	Y	D	K	L	I	S	A	M	D	F	Y	P	T	A	L	D	A	A	D	I	S	I	P	K	D	L	K	L	D	G	V	S	L	L	P	W	L	Q	D
Query Conservation		.	.	.	.	.																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	L	N	L	A	G	E	T	D	G	L	R	G	R	K	D	N	L	W	E	G	G	I	R	V	P	A	I	I	K	Y	G	K	H	L	P	Q	G	M	V	S	D	T	P	V	Y	G	L	D	W	M	P	T	L	A	K	M	M	N	F	K	L	P	T	D	R	T	F	D	G	E	S	L	V	P	V	L	E	Q
Template Known Secondary structure		G	G	T	T						T	T		S			T	T			S					B								T	T	S	S		T	T					S				G	G	G										T					S	S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		K	K	Q	G	E	P	H	K	N	L	T	W	I	T	S	Y	S	H	W	F	D	E	E	N	I	P	F	W	D	N	Y	H	K	F	V	R	H	Q	S	D	D	Y	P	H	N	P	N	T	E	D	L	S	Q	F	S	Y	T	V	R	N	N	D	Y	S	L	V	Y	T	V	E	N	N	Q	L	G	L	Y	K	L	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	L	K	R	E	K	P	L	I	F	G	I	D	M	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	D	P	T	D	E	W	A	I	R	D	G	D	W	K	M	I	I	D	R	N	N	K	P	K	Y	L	Y	N	L	K
Template Known Secondary structure							S	S										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S										T	T							T	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	L	Q	Q	K	D	N	L	A	A	A	N	P	Q	V	V	K	E	M	Q	G	V	V	R	E	F	I	D	S	S	Q	P	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	D	R	Y	E	T	L	N	L	I	G	K	K	P	D	I	E	K	Q	M	Y	G	K	F	L	K	Y	K	T	D	I	D	N	D
Template Known Secondary structure		T		T	T	S		S			T	T	T																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.