Job Description P77318 Confidence 99.43% Date Thu Jan 5 12:27:41 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 292 % Identity 14% Template c3a52A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cold-active alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of cold-active alkailne phosphatase from2 psychrophile shewanella sp. Resolution 2.20 Å

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		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.									.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.				.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.
Query Sequence		N	I	I	V	L	T	M	D	D	L	G	Y	G	Q	L	P	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	S	F	D	P	K	T	M	E	N	R	E	V	V	D	T	Y	K	I	G	I	D	K	A	I	E	A	A	Q	K	S	T	P	T	L	L	S	L	M	D	E	G	V	R	F	T	N	G	Y	.	.	.	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.										.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		G	M	I	I	M	V	G	D	G	M	G	P	A	Y	T	S	A	Y	R	Y	F	Q	D	N	P	D	T	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	Q	T	V	F	D	R	L	L	.	V	G	M	A	S	T	Y	P	A	R	E	S	G
Template Known Secondary structure									T	T																T	T	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.										G	G	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		A	H	G	V	S	G	P	S	R	A	A	I	M	T	G	R	A	P	A	R	F	G	V	Y	S	N	T	D	A	Q	D	G	I	P	L	T	E	T	F	L	P	E	L	F	Q	N	H	G	Y	Y	T	A	A	V	G	K	W	H	L	S	K	I	S	N	V	P	V	P	E	D	K	Q	T	R	D	Y	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	A	L	A	T	G	.	.	.	.	.	F	K	S	Y	N	G	A	I	A	V	D	I	N	K	R	P	L	T	T	I	M	Q	M	A	K	A	R	G	M	S	T	G	V	A	V	T	A	Q	V	N	H	A	T	P	A	A	F	L	T	H	N	E	S	R	K	N	Y	E	A	I
Template Known Secondary structure		S														S	.	.	.	.	.					T	T		B	S	B		T	T			B											T	T											T	T	S										B	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.						.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
										204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.							.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.						250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	N	F	T	T	F	S	A	E	E	W	Q	P	Q	.	.	.	.	.	.	N	R	G	F	D	Y	F	M	G	F	H	A	A	G	T	A	Y	Y	N	S	P	S	L	F	K	N	R	E	R	V	P	.	.	.	.	.	A	K	G	Y	I	S	D	Q	L	T	D	E	A	I	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	D	M	L	K	S	D	A	D	V	I	L	G	G	G	R	K	Y	F	S	E	A	L	V	S	Q	F	S	A	K	G	Y	Q	H	I	T	E	L	A	Q	L	D	S	I	T	Q	P	K	V	L	G	L	F	A	E	V	Q	L	P	W	V	I	D	D	T	D	A	N	T	L	S	K	L	T	Q	K	S	L	D
Template Known Secondary structure									T		S							G	G	G												T	T						S	G	G	G	G	G	G			S	S							S	S	S	S				G	G	G	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	D	R	A	K	T	L	D	Q	P	F	M	L	Y	L	A	Y	N	A	P	H	L	P	N	D	N	P	A	P	D	Q	Y	Q	K	Q	F	N	T	G	S	Q	T	A	D	N	Y	Y	A	S	V	Y	S	V	D	Q	G	V	K	R	I	L	E	Q	L	K	K	N	G	Q	Y	D	N	T	I	I	L	F	T	S
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Conservation							.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Sequence		L	L	S	Q	N	.	.	.	E	K	G	F	V	L	L	V	E	G	S	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	W	A	G	H	N	N	D	I	A	T	A	M	A	E	M	Q	G	F	A	N	A	I	E	V	V	E	Q	Y	I	R	Q	H	P	.	.	.	D	T	L	L	V	V	T	A
Template Known Secondary structure				T	T		.	.	.	T	T									T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T																												.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.				.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.															.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260				.	.	.	.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	G	A	V	I	D	G	P	L	P	L	N	G	A	Q	K	G	Y	K	S	Q	T	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.
Template Sequence		D	H	N	.	T	G	G	L	S	I	G	A	N	G	E	Y	Q	W	D	T	K	L	P	K	G	I	S	A	S	P	A	S	I	A	T	H	A	I	A	A	D	D	W	Q	A	G	V	N	Q	Q	L	G	F	D	V	N	S	T	E	L	Q	Q	L	T	N	A	R	M	Q	G	K	S	T	L	E	V	A	L	K	K
Template Known Secondary structure		S			.		T	T				S	B	T	T	B										T			S													S	S										T	S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		269	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
																	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	H	T	P	M	F	M	W	W	K	G	K	L	Q	P	G	N	Y	D	K	L	I	S	A	M	D	F	Y	P	T	A	L	D	A	A	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																														.	.	.
Template Sequence		I	I	D	T	R	S	Y	T	G	W	T	T	S	G	H	T	G	V	D	V	Q	V	F	A	M	G	P	A	.	.	.	A	D	L	F	K	G	N	Q	D	N	T	H	I	A	E	K	M	M	S	L	L	P
Template Known Secondary structure								T				S		S	S												S	T	T	.	.	.	G	G	G	G																T	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.				.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.