Job Description P77318 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:27:41 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 269 % Identity 19% Template c2zktB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate PDBTitle: structure of ph0037 protein from pyrococcus horikoshii Resolution 2.40 Å

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		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	N	I	I	V	L	T	M	D	D	L	G	Y	G	Q	L	P	F	D	K	G	S	F	D	P	K	T	M	E	N	R	E	V	V	D	T	Y	K	I	G	I	D	K	A	I	E	A	A	Q	K	S	T	P	T	L	L	S	L	M	D	E	G	V	R	F	T	N	G	Y	V	A	H	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	K	G	L	L	I	I	L	D	G	L	G	D	R	P	I	K	E	L	N	G	L	T	P	L	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	T	P	N	M	D	K	L	A	E	I	G	I	L	G	Q	Q	D	P	I	K	P	G	Q	P	A	G	S	D
Template Known Secondary structure											T	T	B	B				B	G	G	G	T	T	B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												S							S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
						130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.																.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	G	V	S	G	P	S	R	A	A	I	M	T	G	R	A	P	A	R	F	G	V	Y	S	N	T	D	A	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	P	L	T	E	T	F	L	P	E	L	F	Q	N	H	G	Y	Y	T	A	A	V	G	K	W	H	L	S	K	I	S
Query Conservation		.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	H	L	S	I	F	G	Y	D	P	Y	E	T	Y	R	G	R	G	F	F	E	A	L	G	V	G	L	D	L	S	K	D	D	L	A	F	R	V	N	F	A	T	L	E	N	A	R	A	I	Q	E	E	V	D	I	G	V	D	F	I	F	K	T	G	H	R	A	V	L	V	L	K	G	M	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T										S								T	T					T	T																																		S	S								.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		N	V	P	V	P	E	D	K	Q	T	R	D	Y	H	D	N	F	T	T	F	S	A	E	E	W	Q	P	Q	N	R	G	F	D	Y	F	M	G	F	H	A	A	G	T	A	Y	Y	N	S	P	S	L	F	K	N	R	E	R	V	P	A	K	G	Y	I	S	D	Q	L	T	D	E	A	I	G	V	V	D	R	A	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	G	Y	K	V	G	D	N	D	P	H	E	A	G	K	P	P	S	K	K	V	A	E	I	L	E	E	F	V	K	K	A	Q	E	V	L	E	K	H	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T							T	T		G	G	G																							T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																									158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
							270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	K	T	L	D	Q	P	F	M	L	Y	L	A	Y	N	A	P	H	L	P	N	D	N	P	A	P	D	Q	Y	Q	K	Q	F	N	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	E	R	R	R	K	E	G	K	P	I	A	N	Y	L	L	I	R	G	A	G	T	Y	P	N	I	P	M	K	F	T	E	Q	W	K	V	K	A	A	G	V	I	A	V	A	L	V	K	G	V	A	R	A	V	G	F	D	V	Y	T	P	E	G	A	T	G	E	Y	N	T	N	E	M	A	K	A	K	K	A
Template Known Secondary structure									T	T															S				S	S							T									S										T	T							T	T			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
																								305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	T	A	D	N	Y	Y	A	S	V	Y	S	V	D	Q	G	V	K	R	I	L	E	Q	L	K	K	N	G	Q	Y	D	N	T	I	I	L	F	T	S	D	N	G	A	V	I	D	G	P	L	P	L	N	G	A	Q	K	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	L	L	K	D	Y	D	F	V	F	L	H	F	K	P	T	D	A	A	G	H	D	N	K	P	K	L	K	A	E	L	I	E	R	A	D	R	M	I	G	Y	I	L	D	H	V	D	.	.	.	.	L	E	E	V	V	I	A	I	T	G	D	H	S	T	P	C	E	V	M	N	H	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T		S															T	T																					T	T			.	.	.	.	T	T	T								S	S	B			T	T	T	T	S		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.					.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390												.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	S	Q	T	Y	P	G	G	T	H	T	P	M	F	M	W	W	K	G	K	L	Q	P	G	N	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	I	S	A	M	D	F	Y	P	T	A	L	D	A	A	D	I	S
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	S	G	D	P	V	P	L	L	I	A	G	G	G	V	R	T	D	D	T	K	R	F	G	E	R	E	A	M	K	G	G	L	G	R	I	R	G	H	D	I	V	P	I	M	M	D	L	M	N	R	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	B										S	T	T					S			S		S					T	T		T	T					G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.