Job Description P77318 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:27:41 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 379 % Identity 19% Template c2w8dB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid synthase 2; PDBTitle: distinct and essential morphogenic functions for wall- and2 lipo-teichoic acids in bacillus subtilis Resolution 2.35 Å

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		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130
Predicted Secondary structure																																																																		.	.												.
Query SS confidence																																																																		.	.												.
Query Sequence		T	K	G	K	P	N	I	I	V	L	T	M	D	D	L	G	Y	G	Q	L	P	F	D	K	G	S	F	D	P	K	T	M	E	N	R	E	V	V	D	T	Y	K	I	G	I	D	K	A	I	E	A	A	Q	K	S	T	P	T	L	L	S	L	M	D	.	.	E	G	V	R	F	T	N	G	Y	V	A	.	H	G
Query Conservation																																																																		.	.												.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.												.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	E	G	K	N	V	I	Y	V	S	L	E	S	L	Q	S	F	I	I	D	Y	K	I	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	V	T	P	F	L	N	K	L	A	H	D	N	E	T	F	Y	F	D	N	F	F	H	Q	T	G	Q
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									T	T			G	G	G	T	T				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S									S	S	S	S				S	S							T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	G	P	S	R	A	A	I	M	T	G	R	A	P	A	R	F	G	V	Y	S	N	T	D	A	Q	D	G	I	P	L	T	E	T	F	L	P	E	L	F	Q	N	H	G	Y	Y	T	A	A	V	G	K	W	H	L	S	K	I	S	N	V	P	V	P	E	D	K	Q	T	R	D	Y	H	D	N	F	T	T	F
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	S	D	A	E	F	X	X	E	N	S	L	Y	P	L	A	Q	G	S	V	F	V	N	K	A	Q	N	T	L	Q	.	.	.	.	S	V	P	A	I	L	K	S	K	N	Y	T	S	A	T	F	H	G	N	T	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F
Template Known Secondary structure		T																S	S	S							T	T	S				.	.	.	.						G	G	G	G	T								S	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.					.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.																							.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	E	E	W	Q	P	Q	N	R	G	F	D	Y	F	M	G	F	H	A	A	G	T	A	Y	Y	N	S	P	S	L	F	K	N	R	E	R	V	P	A	K	G	Y	I	S	D	Q	L	T	D	E	A	I	G	V	V	D	R	A	K	T	L	D	Q	P	F	M	L	Y	L	A	Y	N	A	P	H	L	P	N	D
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Sequence		W	N	R	N	E	X	Y	K	A	E	G	I	D	K	F	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	Y	Y	D	X	N	E	E	N	T	K	N	Y	G	X	K	D	K	P	F	F	K	E	S	X	P	L	L	E	S	L	.	.	.	P	Q	P	F	Y	T	K	F	I	T	L	S	N	H	F	P	F	G
Template Known Secondary structure		G	G									T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S				T	T	T	B		S	S	S	B															T	S	.	.	.		S	S									S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.											.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.				.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.				.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.
Query Sequence		N	P	A	P	D	Q	Y	Q	K	Q	F	N	T	G	S	Q	T	A	D	N	Y	Y	A	S	V	Y	S	V	D	Q	G	V	K	R	I	L	E	Q	L	K	K	N	G	Q	Y	D	N	T	I	I	L	F	T	S	D	N	G	A	V	I	D	G	P	L	P	L	.	.	.	N	G	A	Q	K	G	Y	K	S	Q	T
Query Conservation																																																																				.	.	.
Alig confidence																																																																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		X	D	E	G	D	T	D	F	P	A	G	D	F	G	D	S	V	V	D	N	Y	F	Q	S	A	H	Y	L	D	Q	S	I	E	Q	F	F	N	D	L	K	K	D	G	L	Y	D	K	S	I	I	V	X	Y	G	D	H	Y	G	I	S	E	N	H	N	K	A	X	A	K	V	L	G	K	D	E	I	T	D	Y	D
Template Known Secondary structure				B	T	T	B							S	S																												T	S		G	G	G									S		S	S		G	G	G								T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	G	G	T	H	T	P	M	F	M	W	W	K	G	K	L	Q	P	G	N	Y	D	K	L	I	S	A	M	D	F	Y	P	T	A	L	D	A	A	D	I	S	I	P	K	D	L	K	L	D	G	V	S	L	L	P	W	L	Q	D	K	K	Q	G	E	P	H	K	N	L	T	W	I	T	S	Y	S	H	W	F
Query Conservation
Alig confidence																	.																																.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.																																.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	Q	L	Q	R	V	P	L	F	I	H	A	A	G	.	V	K	G	E	K	V	H	K	Y	A	G	D	V	D	V	A	P	T	I	L	H	L	L	G	V	D	T	K	D	Y	L	.	X	S	G	S	D	I	L	S	K	E	H	R	E	V	I	P	F	R	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	B								T	T	.	S							S				G	G	G									T	T				T	T	S		.						T	T	S	T	T								T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.																																.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.		.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.		.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.				.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.		.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.														.
Query SS confidence																																																.	.	.														.
Query Sequence		D	E	E	N	I	P	F	W	D	N	Y	H	K	F	V	R	H	Q	S	D	D	Y	P	H	N	P	N	T	E	D	L	S	Q	F	S	Y	T	V	R	N	N	D	Y	S	L	V	.	.	.	Y	T	V	E	N	N	Q	L	G	L	Y	K	L	.	T	D	L	Q	Q	K	D	N	L	A	A	A	N	P	Q	V	V
Query Conservation																																																.	.	.														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	I	S	P	K	Y	T	K	I	S	G	K	Y	Y	D	T	K	T	G	K	E	L	D	E	S	E	V	D	K	S	E	D	S	L	V	K	K	E	L	E	X	S	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S					T	T					T	T	T			B			T	T	T	S		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																						563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.		.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		K	E	M	Q	G	V	V	R	E	F	I	D	S	.	S	Q	P	P	L	S	E	V	N	Q	E
Query Conservation															.
Alig confidence															.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	I	N	G	D	L	L	R	F	Y	E	P	K	G	F	K	K	V	N	P	S	D	Y	D
Template Known Secondary structure							T	G	G	G	G				T	T						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.