Job Description P0A7D4 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:17 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 319 % Identity 43% Template c2d7uA_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:adenylosuccinate synthetase; PDBTitle: crystal structure of hypothetical adenylosuccinate synthetase, ph04382 from pyrococcus horikoshii ot3 Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.			.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.
Query SS confidence																											.	.
Query Sequence		M	G	N	N	V	V	V	L	G	T	Q	W	G	D	E	G	K	G	K	I	V	D	L	L	T	.	.	E	R	A	K	Y	V	V	R	Y	Q	G	G	H	N	A	G	H	T	L	V	I	N	G	E	K	T	V	L	H	L	I	P	S	G	I	L	R	E	N	V	T	S	I	I	G	N	G	V	V	L	S	P	A
Query Conservation																											.	.
Alig confidence						.																					.	.
Template Conservation						.
Template Sequence		M	P	S	V	.	I	V	V	G	G	Q	W	G	D	E	G	K	G	S	I	V	A	Y	L	S	L	H	D	E	P	E	I	I	A	R	G	G	V	G	T	N	A	G	H	S	V	V	I	N	G	K	K	Y	A	V	R	Q	I	P	T	G	F	M	Q	T	K	A	R	L	L	I	G	A	G	V	L	V	D	P	E
Template Known Secondary structure						.					S	S	S	S		S	S												T			S						S	S	S	S	S								T	T						S	S	S		T	T	T	T		S	S	S	B					T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		1	.	.	.		.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	M	K	E	M	K	E	L	E	D	R	G	I	P	V	R	E	R	L	L	L	S	E	A	C	P	L	I	L	D	Y	H	V	A	L	D	N	A	R	E	K	A	R	G	A	K	A	I	G	T	T	G	R	G	I	G	P	A	Y	E	D	K	V	A	R	R	G	L	R	V	G	D	L	F	D	K	E	T	F
Query Conservation
Alig confidence																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Conservation																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Sequence		V	F	F	H	E	L	E	Q	L	K	D	F	N	V	K	.	.	D	R	V	G	I	D	Y	R	C	A	I	I	E	E	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Q	S	G	C	G	P	A	N	A	D	R	V	M	R	K	A	K	Q	A	K	D	V	K	E	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	G	G	G	T	G	G	.	.	G	T					T	T		B	B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	T		S		B	G	G	G		S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.			.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	K	L	K	E	V	M	E	Y	H	N	F	Q	L	V	N	Y	Y	K	A	E	A	V	D	Y	Q	K	V	L	D	D	T	M	A	V	A	D	I	L	T	S	M	V	V	D	V	S	D	L	L	D	Q	A	R	Q	R	G	D	F	V	M	F	E	G	A	Q	G	T	L	L	D	I	D	H	G	T	Y	P	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	P	Y	L	T	D	V	A	Q	E	I	N	D	A	L	D	E	G	S	L	V	L	V	E	G	T	Q	G	F	G	L	S	L	Y	Y	G	T	Y	P	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T														T	T											G	G	G		T	T	T	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																									152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	S	S	N	T	T	A	G	G	V	A	T	G	S	G	L	G	P	R	Y	V	D	Y	V	L	G	I	L	K	A	Y	S	T	R	V	G	A	G	P	F	P	T	E	L	F	D	E	T	G	E	F	L	C	K	Q	G	N	E	F	G	A	T	T	G	R	R	R	R	T	G	W	L	D	T	V	A	V	R	R
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.
Template Conservation																																																								.	.
Template Sequence		V	T	S	K	D	V	T	A	S	S	V	A	A	D	V	G	I	G	P	T	R	V	D	E	V	I	V	V	F	K	S	F	P	T	R	V	G	A	G	P	F	P	T	E	M	P	M	E	E	A	D	R	L	G	.	.	L	V	E	Y	G	T	V	T	G	R	R	R	R	V	G	W	F	D	F	E	M	A	R	Y
Template Known Secondary structure		S		S	S			S									T			G	G	G										S	S					S	S	S			T	T	B									T	T	.	.				B		T	T	T			B				B
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.			.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	Q	L	N	S	L	S	G	F	C	L	T	K	L	D	V	L	D	G	L	K	E	V	K	L	C	V	A	Y	R	M	P	D	G	R	E	V	T	T	T	P	L	A	A	D	D	W	K	G	V	E	P	I	Y	E	T	M	P	G	W	S	E	S	T	F	G	V	K	D	R	S	G	L	P	Q	A	A	L	N
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	R	I	N	G	A	T	M	L	A	V	T	M	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	D	K	E	A	F	G	V	T	D	Y	D	K	L	P	R	K	A	K	E
Template Known Secondary structure						T	T		S							G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T		G	G	G	T	T			S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	K	R	I	E	E	L	T	G	V	P	I	D	I	I	S	T	G	P	D	R	T	E	T	M	I	L	R	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	I	E	E	I	E	E	R	V	G	V	P	V	G	L	I	K	T	G	P	E	L	E	H	I	I	D	R	R	D
Template Known Secondary structure											S	S								S	S	B	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.