Job Description Q46814 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:41 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 880 % Identity 27% Template c1wygA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:xanthine dehydrogenase/oxidase; PDBTitle: crystal structure of a rat xanthine dehydrogenase triple mutant2 (c535a, c992r and c1324s) Resolution 2.60 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.		.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.											.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure														.															.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.															.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	H	F	T	L	N	G	A	P	Q	E	L	.	T	V	N	P	G	E	N	V	Q	K	L	L	F	N	.	M	G	M	H	S	V	R	N	S	D	D	G	F	G	F	A	G	S	D	A	I	I	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	I	V	N	A	S	L	L	I	A	A	Q	L	E	K	A	D
Query Conservation														.															.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.															.											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.
Template Sequence		L	V	F	F	V	N	G	K	K	V	V	E	K	N	A	D	P	E	T	T	L	L	V	Y	L	R	R	K	L	G	L	C	G	T	K	L	G	C	.	G	E	G	G	C	G	A	C	T	V	M	I	S	K	Y	D	R	L	Q	N	K	I	V	H	F	S	V	N	A	C	L	A	P	I	C	S	L	H	H	V	A
Template Known Secondary structure							T	T						S	S			T	T		B								S	S				S	S			S		.	S	S	S	S	S		T	T									T	T	T	T									T	T	T		B	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.		.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	T	A	E	S	L	G	K	W	N	E	L	S	L	V	Q	Q	A	M	V	D	V	G	V	V	Q	S	G	Y	N	D	P	A	A	A	L	I	I	T	D	L	L	D	R	I	A	A	P	T	R	E	E	I	D	D	A	L	S	G	L	F	S	R	D	A	G	W	Q	Q	Y	Y	Q	V	I	E	L	A	V	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	T	T	V	E	G	I	G	N	T	Q	K	L	H	P	V	Q	E	R	I	A	R	S	H	G	S	Q	C	G	F	C	T	P	G	I	V	M	S	M	Y	T	L	L	R	N	Q	P	E	P	T	V	E	E	I	E	N	A	F	Q	G	N	L	C	R	C	T	G	Y	R	P	I	L	Q	G	F	R	T	F	A	K
Template Known Secondary structure					G	G	G	T			S	S	S											T	T			S	S		S	S																S	S										G	G	G				S	S	S		S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	N	N	P	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	L	F	N	P	E	D	F	K	P	L	D	P	T	Q	E	P	I	F	P	P	E	L	L	R	L	K	D	T	P	Q	K	K	L	R	F	E	G	E	R	V	T	W	I	Q	A	S	T	M	E	E	L	L	D	L	K	A	Q	H	P	D	A	K	L	V	V	G	N	T	E	I	G	I	E	M	K	F	K	N
Template Known Secondary structure				S			G	G	G	S					G	G	G	S											T	T	S										S	S								S												T	T					S	S		T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	L	F	P	L	I	V	C	P	A	W	I	P	E	L	N	S	V	V	H	G	P	E	G	I	S	F	G	A	S	C	P	L	S	L	V	E	S	V	L	A	E	E	I	A	K	L	P	E	Q	K	T	E	V	F	R	G	V	M	E	Q	L	R	W	F	A	G	K	Q	V	K	S	V	A	S	I	G	G	N	I
Template Known Secondary structure					S						T	T		S	G	G	G						S	S						T	T		B															S		T	T	T												T	T	S	S						T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	T	A	S	P	I	S	D	L	N	P	V	F	M	A	S	G	A	K	L	T	L	V	S	R	G	T	R	R	T	V	R	M	D	H	T	F	F	P	G	Y	R	K	T	L	L	R	P	E	E	I	L	L	S	I	E	I	P	Y	S	K	E	G	E	F	F	S	A	F	K	Q	A	S	R	R	E	D	D	I	A
Template Known Secondary structure						T	T		S	S						T	T	T								S	S								S	T	T	T			S	T	T			S			T	T													T	T										S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	T	S	G	M	R	V	L	F	K	P	G	T	I	E	V	Q	E	L	S	L	C	F	G	G	M	A	D	R	T	I	S	A	L	K	T	T	P	K	Q	L	S	K	S	W	N	E	E	L	L	Q	S	V	C	A	G	L	A	E	E	L	Q	L	A	P	D	A	P	G	G	M	V	E	F	R	R	T	L	T
Template Known Secondary structure		S											T	T	S		B										S	S	S	S	S					T	T	T	T	G	G	G	T	T		B	S	S															T				T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
																																																	158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	D	I	A	P	T	F	R	D	D	L	E	V	I	G	K	H	Y	P	K	T	D	A	A	K	M	V	Q	A	K	P	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	F	F	F	K	F	Y	L	T	V	L	Q	K	L	G	R	A	D	L	E	D	M	A	G	K	L	D	P	T	F	A	S	A	T	L	L	F	Q	K	D	P	P	A	N	V	Q	L	F	Q	E	V	P	K	D	Q	S	E	E	D	M	V	G	R	P	L	P	H	L	A	A	N	M	Q	A	S	G	E	A	V
Template Known Secondary structure																		T	T	T	T									T	T	T	S	G	G	G																			S	S	S		T	T			T	T	S					T	T							T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
		191	.	.	.	.		.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		Y	V	E	D	R	.	V	T	A	D	A	C	V	I	K	M	L	R	S	P	H	A	H	A	L	I	T	H	L	D	V	S	K	A	E	A	L	P	G	V	V	H	V	I	T	H	L	N	C	P	D	I	Y	Y	T	P	G	G	Q	S	A	P	E	P	S	P	L	D	R	R	M	F	G	K	K	M	R	H	V	G
Query Conservation							.
Alig confidence							.																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	C	D	D	I	P	R	Y	E	N	E	L	S	L	R	L	V	T	S	T	R	A	H	A	K	I	T	S	I	D	T	S	E	A	K	K	V	P	G	F	V	C	F	L	T	A	E	D	V	P	N	S	N	A	T	G	L	F	N	.	.	.	.	.	.	.	D	E	T	V	F	A	K	D	E	V	T	C	V	G
Template Known Secondary structure			G	G	G	S				S	S										S	S	S	S									T	T	G	G	G	S	T	T							S	T	T		S	S					S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.				S	S			S				S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650								.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	V	A	A	V	V	A	E	S	E	E	I	A	L	E	A	L	K	L	I	D	V	E	Y	E	V	L	K	P	V	M	S	I	D	E	A	M	A	E	D	A	P	V	V	H	D	E	P	V	V	Y	V	A	G	A	P	D	T	L	E	D	D	N	S	H	A	A	Q	R	G	E	H	M	I	I	N	F	P	I
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	I	I	G	A	V	V	A	D	T	P	E	H	A	Q	R	A	A	R	G	V	K	I	T	Y	E	D	L	P	A	I	I	T	I	Q	D	A	I	N	N	N	S	F	Y	G	S	E	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S	S									T	T													S								T		B	S	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.			.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.
Query SS confidence																																																							.	.
Query Sequence		G	S	R	P	R	K	N	I	A	A	S	I	H	G	H	I	G	D	M	D	K	G	F	A	D	A	D	V	I	I	E	R	T	Y	N	S	T	Q	A	Q	Q	C	P	T	E	T	H	I	C	F	T	R	M	.	.	D	G	D	R	L	V	I	H	A	S	T	Q	V	P	W	H	L	R	R	Q	V	A	R	L	V
Query Conservation																																																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	K	G	D	L	K	K	G	F	S	E	A	D	N	V	V	S	G	E	L	Y	I	G	G	Q	E	H	F	Y	L	E	T	N	C	T	I	A	V	P	K	G	E	A	G	E	M	E	L	F	V	S	T	Q	N	T	M	K	T	Q	S	F	V	A	K	M	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S								T		S												B					S	S										S	S	T	T									S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															714	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.			.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.
Query SS confidence																											.	.
Query Sequence		G	M	K	Q	H	K	V	H	V	I	K	E	R	V	G	G	G	F	G	S	K	Q	D	I	L	.	.	L	E	E	V	C	A	W	A	T	C	V	T	G	R	P	V	L	F	R	Y	T	R	E	E	E	F	I	A	N	T	S	R	H	V	A	K	V	T	V	K	L	G	A	K	K	D	G	R	L	T	A	V	K
Query Conservation																											.	.
Alig confidence																											.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	P	D	N	R	I	V	V	R	V	K	R	M	G	G	G	F	G	G	K	E	T	R	S	T	V	V	S	T	A	L	A	L	A	A	H	K	T	G	R	P	V	R	C	M	L	D	R	D	E	D	M	L	I	T	G	G	R	H	P	F	L	A	K	Y	K	V	G	F	M	K	T	G	T	V	V	A	L	E
Template Known Secondary structure		T			G	G	G						S			S			T	T	T	T	S	S	S	T															S	S																		B													T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		781	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	D	F	R	A	N	T	G	P	Y	G	N	H	S	L	T	V	P	C	N	G	P	A	L	S	L	P	L	Y	P	C	D	N	V	D	F	Q	V	T	T	Y	Y	S	N	I	C	P	N	G	A	Y	Q	G	Y	G	A	P	K	G	N	F	A	I	T	M	A	L	A	E	L	A	E	Q	L	Q	I	D	Q	L	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	A	H	F	S	N	G	G	N	T	E	D	L	S	R	S	I	M	E	R	A	L	F	H	M	D	N	A	Y	K	I	P	N	I	R	G	T	G	R	I	C	K	T	N	L	P	S	N	T	A	F	R	G	F	G	G	P	Q	G	M	L	I	A	E	Y	W	M	S	E	V	A	I	T	C	G	L	P	A	E	E
Template Known Secondary structure										S	S		T	T										T	T	T	T	T	T	B			S	S											S	S							T	T	T	T																				T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		861	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.						.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	E	R	N	R	V	H	E	G	Q	E	L	K	I	L	G	A	I	G	E	G	K	A	P	T	S	V	P	S	A	A	S	C	A	L	E	E	I	L	R	Q	G	R	E	M	I	Q	W	S	S	P	.	.	.	.	.	K	P	Q	N	G	D	W	H	I	G	R	G	V	A	I	I	M	Q	K	S	G	I	P
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	R	K	N	M	Y	K	E	G	D	L	T	H	F	N	Q	K	L	E	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	P	R	C	W	D	E	C	I	A	S	S	Q	Y	L	A	R	K	R	E	V	E	K	F	N	R	E	N	R	W	K	K	R	G	L	C	I	I	P	T	K	F	G	I	S
Template Known Secondary structure							B			T	T		B		T	T			B			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T														S		S	S															S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		941	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.													.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.
		661	.					.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.
Query Sequence		D	I	.	.	.	.	D	Q	A	N	C	M	I	K	L	E	S	D	G	T	F	I	V	H	S	G	G	A	D	I	G	T	G	L	D	T	V	V	T	K	L	A	A	E	V	L	H	C	P	P	Q	D	V	H	V	I	S	G	D	T	D	H	A	L	F	D	K	G	A	Y	A	S	S	G	T	C	F	S	G	N
Query Conservation				.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	T	L	P	F	L	N	Q	G	G	A	L	V	H	V	Y	T	D	G	S	V	L	L	T	H	G	G	T	E	M	G	Q	G	L	H	T	K	M	V	Q	V	A	S	R	A	L	K	I	P	T	S	K	I	H	I	S	E	T	S	T	N	T	V	P	N	T	S	P	T	A	A	S	A	S	A	D	L	N	G	Q
Template Known Secondary structure			S	S	G	G	G											T	T	S							S				S	S	S														T	T	S		G	G	G								T	T	T	S		S				S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1009	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.
		737	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	R	L	A	A	E	N	L	R	E	K	I	L	F	H	G	A	Q	M	L	G	E	P	V	A	D	V	Q	L	A	T	P	G	V	V	R	G	K	K	G	E	V	S	F	G	D	I	A	H	K	G	E	T	G	T	G	F	G	S	L	V	G	T	G	S	Y	I	T	P	D	F	A	F	P	Y	G	A	N	F
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Sequence		G	V	Y	E	A	C	Q	T	I	L	K	R	L	E	P	F	K	K	K	K	P	T	G	P	W	E	A	W	.	.	.	.	.	.	V	M	D	A	Y	T	S	A	V	S	L	.	.	.	S	A	T	G	F	Y	K	T	P	N	L	G	Y	S	F	E	T	N	S	G	N	P	F	H	Y	F	S	Y	G	V	A	C
Template Known Secondary structure																					S	T	T	S						.	.	.	.	.	.							T	T				.	.	.									T	T				B	T	T	T	T	B	S				S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template SS confidence
		1089	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.							.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.				.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		817	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	V	A	V	N	T	R	T	G	E	I	R	L	D	K	F	Y	A	L	L	D	C	G	T	P	V	N	P	E	L	A	L	G	Q	I	Y	G	A	T	L	R	A	I	G	H	S	M	S	E	E	I	I	Y	D	A	E	G	H	P	L	T	R	D	L	R	S	Y	G	A	P	K	I	G	D	I	P	R	D	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	E	V	E	I	D	C	L	T	G	D	H	K	N	L	R	T	D	I	V	M	D	V	G	S	S	L	N	P	A	I	D	I	G	Q	V	E	G	A	F	V	Q	G	L	G	L	F	T	M	E	E	L	H	Y	S	P	E	G	S	L	H	T	R	G	P	S	T	Y	K	I	P	A	F	G	S	I	P	I	E	F
Template Known Secondary structure								T	T	T	S		B				B								B	S		S																						T					B		T	T	S		B				S	T	T	T	S					G	G	G	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		897	.	.	900	.		.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.				.	.	.	.	930	.	.	.	.				.	.	.	.	.	940	.	.						.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																									.	.	.										.	.	.									.	.	.	.	.
Query SS confidence							.																									.	.	.										.	.	.									.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	V	L	V	.	P	S	D	D	K	V	G	P	F	G	A	K	S	I	S	E	I	G	V	N	G	A	A	P	.	.	.	A	I	A	T	A	I	H	D	A	.	.	.	C	G	I	W	L	R	E	W	.	.	.	.	.	H	F	T	P	E	K	I	L	T	A	L	E	K
Query Conservation							.																									.	.	.										.	.	.									.	.	.	.	.
Alig confidence							.																									.	.	.										.	.	.									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	S	L	L	R	D	C	P	N	K	R	A	I	Y	A	S	K	A	V	G	E	P	P	L	F	L	A	S	S	I	F	F	A	I	K	D	A	I	R	A	A	R	A	Q	H	G	D	N	A	K	Q	L	F	Q	L	D	S	P	A	T	P	E	K	I	R	N	A	C	V	D
Template Known Secondary structure							S	S				T	T	T	G	G	G	B				S	S	G	G	G	G	G	G																T	T	S	S			S		S	S					B	S										S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310