Job Description P11988 Confidence 97.44% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 143 Aligned Residues 212 % Identity 17% Template d2v3ga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.20

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		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																.		.	.	.	.	.																	.	.														.
Template Conservation																																.		.	.	.	.	.																	.	.														.
Template Sequence		R	P	Y	A	D	A	V	Y	N	N	G	S	I	L	M	I	T	W	E	P	W	E	Y	N	T	V	D	I	K	N	.	G	.	.	.	.	.	K	A	D	A	Y	I	T	R	M	A	Q	D	M	K	A	Y	.	.	G	K	E	I	W	L	R	P	L	H	E	A	N	.	G	D	W	Y	P	W	A	I	G	Y	S
Template Known Secondary structure											T	T										T	T								T	.	T	.	.	.	.	.	T	T															.	.		S							S			T	T	.	S	S	S	S	T	T	S	T	T		T
Template Predicted Secondary structure																																.		.	.	.	.	.																	.	.														.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.						.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.			.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.		.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.		.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	.	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G
Query Conservation																																.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.																.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	V	N	T	N	E	T	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	A	A	F	R	H	I	V	D	I	F	R	A	N	G	A	T	N	V	K	W	V	F	N	V	N	C	D	N	V	G	N	G	T	S	Y	L	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	G
Template Known Secondary structure		T								.	.	.	.	.	.	.															T	T		T	T				B					S	S			S	T	T			S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130								.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170																							.	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	Y	T	S	I	D	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	G	T	T	Q	S	W	G	S	Q	W	Q	S	F	D	Q	V	F	S	R	A
Template Known Secondary structure		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		174	.	.																								.	.	.	180	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A
Query Conservation
Alig confidence									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Sequence		Y	Q	A	L	A	S	I	.	N	K	P	I	I	I	A	E	F	A	S	A	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	N	K	A	R	W	I	T	E	A	Y	N	S	I	R	T	S	.	.	.	Y	N	K	V	I	A	A	V	W	F	H	E	N	K	E	T	D	W
Template Known Secondary structure						T	T	S	.	S	S											S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S																	.	.	.		T	T										B	S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.											.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.				.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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