Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 440 % Identity 31% Template d1wcga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.10

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	P	K	D	F	M	F	G	T	S	T	A	S	Y	Q	I	E	G	G	W	N	E	D	G	K	G	E	N	I	W	D	R	L	V	H	.	.	.	.	.	T	S	P	E	V	I	K	D	G	T	N	G	D	I	A	C	D	S	Y	H	K	Y	K	E	D	V	A	I	I	K	D	L	N	L	K	F	Y	R	F
Template Known Secondary structure					T	T																T	T	S	T	T				B								.	.	.	.	.			G	G	G	S	T	T	S			S	S	S	T	T																	T		S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.						40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H
Query Conservation
Alig confidence																																																								.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		S	I	S	W	A	R	I	A	P	S	G	V	M	N	S	L	E	P	K	G	I	A	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	I	K	N	D	I	I	P	L	V	T	M	Y	H	W	D	L	P	Q	Y	L	Q	D	L	.	G	G	W	V	N	P	I	M	S	D	Y	F	K	E	Y	A	R	V	L	F	T	Y	F	G	D
Template Known Secondary structure									S	T	T	S		T	T	S																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T	T																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.																														.	.	.
Query SS confidence																													.																														.	.	.
Query Sequence		K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	.	.	.	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P
Query Conservation																													.																														.	.	.
Alig confidence																													.																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	K	W	W	I	T	F	N	E	P	I	A	V	C	K	G	Y	S	I	K	A	Y	A	P	N	L	N	L	K	T	T	G	H	Y	L	A	G	H	T	Q	L	I	A	H	G	K	A	Y	R	L	Y	E	E	M	F	K	P	T	Q	N	G	K	I	S	I	S	I	S	G	V	F	F	M	P	K	N	A	E	S
Template Known Secondary structure		T																			S	S	S	S	T	T																															T																				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.			.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.									.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D
Query Conservation											.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	D	I	E	T	A	E	R	A	N	Q	F	E	R	G	W	F	G	H	P	V	Y	K	G	D	Y	P	P	I	M	K	K	W	V	D	Q	K	S	K	E	E	G	L	P	W	S	K	L	P	K	F	T	K	D	E	I	K	L	L	K	G	T	A	D	F	Y	A	L	N	H	Y	S	S	R	L	V	T	F	G
Template Known Secondary structure																T									T	S	S	S															T	T		S	S		S	S												T	T			S	S														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.		.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																							.																						.
Query SS confidence							.	.																							.																						.
Query Sequence		E	S	I	N	K	.	.	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y
Query Conservation							.	.																							.																						.
Alig confidence							.	.																							.																						.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	P	N	P	N	F	N	P	D	A	S	Y	V	T	S	V	D	E	A	W	L	K	P	N	E	T	P	Y	I	I	P	V	P	E	G	L	R	K	L	L	I	W	L	K	N	E	Y	G	N	P	Q	L	L	I	T	E	N	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	D	D	G	Q	L	D	D	F	E	K	I	S	Y
Template Known Secondary structure				S	S	T	T	S		G	G	G								G	G	G			S	S				S	S																			T	S												.	.	.	.	.	.	B	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.							.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	.	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R
Query Conservation														.
Alig confidence														.																								.																.	.	.
Template Conservation																																						.																.	.	.
Template Sequence		L	K	N	Y	L	N	A	T	L	Q	A	M	Y	E	D	K	C	N	V	I	G	Y	T	V	W	S	L	L	D	N	F	E	W	F	Y	G	.	Y	S	I	H	F	G	L	V	K	I	D	F	N	D	P	.	.	.	Q	R	T	R	T	K	R	E	S	Y	T	Y	F	K	N	V	V	S	T	G
Template Known Secondary structure																												S	B					G	G	G	G	.	G	G	S	B			S					T	T	S	T	.	.	.	T																			S
Template Predicted Secondary structure																																						.																.	.	.
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.