Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 411 % Identity 28% Template d1vffa1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.50

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	P	E	M	F	L	F	G	T	A	T	S	S	H	Q	I	E	G	N	.	.	.	.	N	R	W	N	D	W	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	Q	I	G	K	L	P	Y	R	S	G	K	A	C	N	H	W	E	L	Y	R	D	D	I	Q	L	M	T	S	L	G	Y	N	A	Y	R	F
Template Known Secondary structure					T	T									S	T	T	T	S	S		.	.	.	.		T	T	B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S	S			S				T	T																	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.					.	.	.	.	.	.	30	.											.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H
Query Conservation
Alig confidence													.	.																																										.																					.
Template Conservation													.	.																																										.																					.
Template Sequence		S	I	E	W	S	R	L	F	P	E	E	.	.	N	K	F	N	E	D	A	F	M	K	Y	R	E	I	I	D	L	L	L	T	R	G	I	T	P	L	V	T	L	H	H	F	T	S	P	L	W	F	M	K	K	.	G	G	F	L	R	E	E	N	L	K	H	W	E	K	Y	I	E	K	V	A	.	E	L	L	E
Template Known Secondary structure										S	B	T	.	.	T	B																			T	T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	G	G	G													.			T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.																																										.																					.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.																										.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.
Template Sequence		K	V	K	L	V	A	T	F	N	E	P	M	V	Y	V	M	M	G	Y	L	T	A	Y	W	P	P	F	I	R	S	P	F	K	A	F	K	V	A	A	N	L	L	K	A	H	A	I	A	Y	E	L	L	H	.	.	.	G	K	F	K	V	G	I	V	K	N	I	P	I	I	L	P	A	S	D	K	E	R	D	R
Template Known Secondary structure		T																			T	S		S	S	T	T																											T	.	.	.	T	T	S														S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.				.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.		.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	.	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L
Query Conservation														.
Alig confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		K	A	A	E	K	A	D	N	L	F	N	W	H	F	L	D	A	I	W	S	G	K	Y	R	G	V	F	K	T	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	Q	S	D	A	D	F	I	G	V	N	Y	Y	T	A	S	E	V	R	H	T	W	N	.	.	.	P	L	K	F	F	F	E
Template Known Secondary structure												T															S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S																S		.	.	.	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.																.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.				.	.	280	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V
Query Conservation
Alig confidence																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	L	A	D	I	S	E	R	K	T	Q	M	G	W	S	V	Y	P	K	G	I	Y	M	A	L	K	K	A	.	S	R	Y	G	R	P	L	Y	I	T	E	N	G	I	A	T	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	W	R	V	E	F	I	I	Q	H	L	Q	Y	V	H	K	A	I	E	D	G	L
Template Known Secondary structure								S	S	S			T	T						T											.	G	G	G		S												S		.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	T
Template Predicted Secondary structure																															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.										.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.				.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.
Query Sequence		D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G	L	S	.	.	.	L	K	K	I	T	I	K
Query Conservation																																																															.	.	.
Alig confidence																					.														.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																					.														.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	R	G	Y	F	Y	W	S	F	M	D	N	Y	E	W	K	E	G	.	F	G	P	R	F	G	L	V	E	V	D	Y	Q	.	.	.	.	.	T	F	E	R	R	P	R	K	S	A	Y	V	Y	G	E	I	A	R	S	K	E	I	K	D	E	L	L	K	R	Y	G	L	P
Template Known Secondary structure											S	B					G	G	G	T	.	T						S					T	T	.	.	.	.	.	T																			T											S
Template Predicted Secondary structure																					.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.						.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.