Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 42 Aligned Residues 309 % Identity 17% Template d1vbua1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.80

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		A	E	K	L	N	I	Y	I	G	F	A	A	I	N	N	F	W	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	A	E	K	Y	M	E	V	A	R	.	.	R	E	F	N	I	L	T	P	E	N
Template Known Secondary structure					T	T									T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T										.	.				S					S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
		523	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.			.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
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Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	.	.	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																			.	.													.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.																																	.	.
Template Sequence		Q	M	K	W	D	T	I	H	P	E	R	D	R	Y	N	F	.	.	.	.	.	T	P	A	E	K	H	V	E	F	A	E	E	N	D	M	I	V	H	G	H	T	L	V	W	H	N	Q	L	P	G	W	I	.	.	T	G	R	E	W	T	K	E	E	L	L	N	V	L	E	D	H	I	K	T	V	V	S	H	F
Template Known Secondary structure		T	T	S							B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T											S	S	S						.	.		T	S																						T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.																																	.	.
Template SS confidence
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.						.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610			.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	R	V	K	I	W	D	V	V	N	E	A	V	S	D	S	G	T	Y	R	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	W	Y	K	T	I	G	P	E	Y	I	E	K	A	F	R	W	A	K	E	A	D	P	D	A	I	L	I	Y	N	D	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T									S		B		T	T	S	S	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T															T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.													.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	E	I	N	A	K	S	N	F	V	Y	N	M	I	K	E	L	K	E	K	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	G	I	G	F	Q	M	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S																T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															692	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.															.	.	.	.	720	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	R	G	L	N	Y	D	S	F	R	R	N	L	E	R	F	.	A	K	L	G	L	Q	I	Y	I	T	E	M	D	V	R	I	P	L	S	G	S	.	.	.	.	.	.	E	E	Y	Y	L	K	K	Q	A	E	V	C	A	K	I	F	D	I	C	L	D	N	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T															.		T	T	T														S	S	S		.	.	.	.	.	.																					T	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														726	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.		.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.							.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.				.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.
Query Sequence		D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	.	.	.	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R
Query Conservation																									.	.	.
Alig confidence																					.				.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	K	A	I	Q	F	W	G	F	T	D	K	Y	S	W	V	P	G	.	F	F	K	G	Y	G	K	A	L	L	F	D	E	N	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	C	Y	Y	A	I	K	E	V	L	E	K	K
Template Known Secondary structure		T							S		S	B	T	T	S		S				.		S	T	T					S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																					.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		787	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.		.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.											.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.