Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 445 % Identity 29% Template d1v08a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.9

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	W	F	P	S	D	F	T	F	G	A	A	T	S	A	Y	Q	I	E	G	A	W	N	E	D	G	K	G	E	S	N	W	D	H	F	C	H	N	H	.	.	.	.	.	P	E	R	I	L	D	G	S	N	S	D	I	G	A	N	S	Y	H	M	Y	K	T	D	V	R	L	L	K	E	M	G	M	D	A	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B										.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	T	S				S	S	T	T																T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140				.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																																																.	.	.
Query SS confidence															.																																																.	.	.
Query Sequence		R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	.	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	.	.	.	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V
Query Conservation															.																																																.	.	.
Alig confidence															.																																																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	K	G	T	K	E	G	G	I	N	P	D	G	I	K	Y	Y	R	N	L	I	N	L	L	L	E	N	G	I	E	P	Y	V	T	I	F	H	W	D	V	P	Q	A	L	E	E	K	Y	G	G	F	L	D	K	S	H	K	S	I	V	E	D	Y	T	Y	F	A	K	V	C
Template Known Secondary structure											S	T	T	S	S	T	T	T																				T	T									S	S			B									G	G	G		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.														190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.			.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Query Sequence		F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	.	.	L	L	P	E	A	K
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	N	F	G	D	K	V	K	N	W	L	T	F	N	D	P	Q	T	F	T	S	F	S	Y	G	T	G	V	F	A	P	G	R	C	S	P	G	L	D	C	A	Y	P	T	G	N	S	L	V	E	P	Y	T	A	G	H	N	I	L	L	A	H	A	E	A	V	D	L	Y	N	K	H	Y	K	R	D	D	T	R
Template Known Secondary structure						T	T	T																			T	S			S	T	T		B			T	T	S	S	S	S	B	T	T	S		T	T	T																								T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure																												.
Query SS confidence																												.
Query Sequence		I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y
Query Conservation																												.
Alig confidence																												.																												.	.
Template Conservation																																																								.	.
Template Sequence		I	G	L	A	F	D	V	M	G	R	V	P	Y	G	T	S	F	L	D	K	Q	A	E	E	R	S	W	D	I	N	L	G	W	F	L	E	P	V	V	R	G	D	Y	P	F	S	M	R	S	L	A	R	E	R	.	.	L	P	F	F	K	D	E	Q	K	E	K	L	A	G	S	Y	N	M	L	G	L	N	Y	Y
Template Known Secondary structure														S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.												.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.		.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	.	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	R	F	S	K	N	I	D	I	S	P	N	Y	S	P	V	L	N	T	D	D	A	Y	A	S	Q	E	V	N	G	P	D	G	K	P	I	G	P	P	M	G	N	P	W	I	Y	M	Y	P	E	G	L	K	D	L	L	M	I	M	K	N	K	Y	G	N	P	P	I	Y	I	T	E	N	G	I	G	D	V	D
Template Known Secondary structure													T	T				S	S	G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B	S	S		B		S	S	S	S		B			T													T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		369					370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.
Query Sequence		S	.	.	.	.	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R
Query Conservation			.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																																																			.																.	.	.	.
Template Conservation																																																									.																.	.	.	.
Template Sequence		T	K	E	T	P	L	P	M	E	A	A	L	N	D	Y	K	R	L	D	Y	I	Q	R	H	I	A	T	L	K	E	S	I	D	L	G	S	N	V	Q	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	F	A	G	.	F	T	E	R	Y	G	I	V	Y	V	D	R	N	N	N	.	.	.	.	C	T	R	Y	M
Template Known Secondary structure			S	S	S																														T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S					S					T	T	T	T	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																									.																.	.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.					.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	E	S	A	K	W	L	K	E	F	N	T	A
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.