Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 433 % Identity 25% Template d1uwsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.95

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.
Template Conservation																																																	.	.
Template Sequence		M	Y	S	F	P	N	S	F	R	F	G	W	S	Q	A	G	F	Q	S	E	M	G	T	P	G	S	E	D	P	N	T	D	W	Y	K	W	V	H	D	P	E	N	M	A	A	G	L	.	.	V	S	G	D	L	P	E	N	G	P	G	Y	W	G	N	Y	K	T	F	H	D	N	A	Q	K	M	G	L	K	I	A
Template Known Secondary structure							T	T													S		S	S	T	T						B															T	S	.	.	S		S			G	G	G	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	N	V	E	W	S	R	I	F	P	N	P	L	P	R	P	F	D	E	S	K	Q	D	V	T	E	V	E	I	N	E	N	E	L	K	R	L	D	E	Y	A	N	K	D	A	L	N	H	Y	R	E	I	F	K	D	L	K	S	R	G	L	Y	F	I	L	N	M	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H	D	P
Template Known Secondary structure													S								T	T		S																	T	T	S																		T	T							S		S	S			B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		137											.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.				.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Query Sequence		Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	.	.	.	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	V	R	R	G	D	F	T	G	P	S	G	W	L	S	T	R	T	V	Y	E	F	A	R	F	S	A	Y	I	A	W	K	F	D	D	L	V	D	E	Y	S	T	M	N	E	P	N	V	V	G	G	L	G	Y	V	G	V	K	S	G	F	P	P	G	Y	L	S	F	E	L	S	R	R	A	M	Y	N	I	I
Template Known Secondary structure						T	T			S	S		B	G	G	G	S																			T	T	T		S																	T		G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																																														.
Query SS confidence																																														.
Query Sequence		V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E
Query Conservation																																														.
Alig confidence																.																				.	.									.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																				.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	H	A	R	A	Y	D	G	I	K	S	V	S	.	K	K	P	V	G	I	I	Y	A	N	S	S	F	Q	P	L	T	D	K	.	.	D	M	E	A	V	E	M	A	E	N	D	N	R	W	W	F	F	D	A	I	I	R	G	E	I	T	K	I	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T		.		S														S	S	T	T	.	.													T																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																				.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.			.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.					.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.
Query Sequence		S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	.	.	.	.	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F
Query Conservation																															.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	D	D	L	K	G	R	L	D	W	I	G	V	N	Y	Y	T	R	T	V	V	K	R	T	E	K	G	Y	V	S	L	G	G	Y	G	H	G	C	E	R	N	S	V	S	L	A	G	L	P	T	S	D	F	G	W	E	F	F	P	E	G	L	Y	D	V	L	T	K	Y	W	N	R	Y	H	L	Y	M	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T	T	T	T			S																S	S	S					T	T	S	T	T	S	S		S	S	S	B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	E	N	G	I	A	D	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	Q	R	P	Y	Y	L	V	S	H	V	Y	Q	V	H	R	A	I	N	S	G	A	D	V	R	G	Y	L	H	W	S	L	A	D	N	Y	E	W	A	S	G	.	F	S	M	R	F	G	L	L	K	V	D	Y	N	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		T	T									S		S	B					G	G	G	G	.	G	G	S				S					T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.										.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.		.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.		.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G	L	S	L	K	.	K	I	T	I	K	A	P
Query Conservation																											.
Alig confidence																											.
Template Conservation
Template Sequence		T	K	R	L	Y	W	R	P	S	A	L	V	Y	R	E	I	A	T	N	G	A	I	T	D	E	I	E	H	L	N	S	V	P
Template Known Secondary structure		T																			T				G	G	G	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.