Job Description P11988 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 309 % Identity 19% Template d1ur4a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.2

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	.	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S
Query Conservation														.
Alig confidence														.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	D	F	I	K	G	V	D	V	S	S	I	I	A	L	E	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	A	F	Y	N	E	S	G	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	I	F	K	T	L	K	E	A	G	V	N	Y	V	R	V	R
Template Known Secondary structure			T	T								T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				B		T	T	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50									.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		84					.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.				.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.				.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																																										.	.	.																		.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.																																										.	.	.																		.	.	.
Query Sequence		I	.	.	.	.	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	.	.	.	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	.	.	.	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A
Query Conservation			.	.	.	.																																										.	.	.																		.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.															.	.	.	.																								.	.	.												.						.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.																																						.
Template Sequence		I	W	N	D	P	Y	D	A	N	G	N	G	Y	G	G	G	N	N	D	.	.	.	.	L	E	K	A	I	Q	I	G	K	R	A	T	A	N	G	M	K	L	L	A	D	F	H	Y	S	D	F	W	A	D	P	A	K	Q	K	A	P	.	K	A	W	A	N	L	N	F	E	D	K	K	T	A	L	Y	Q	Y	T
Template Known Secondary structure				S			B		T	T			B		S	T	T				.	.	.	.														T	T									S	S	S	S			S	S	S						.	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.					.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure											.	.	.
Query SS confidence											.	.	.
Query Sequence		R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	.	.	.	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L
Query Conservation											.	.	.
Alig confidence											.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	S	L	K	A	M	K	A	A	G	I	D	I	G	M	V	Q	V	G	N	E	T	N	G	G	L	A	G	E	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	A	K	M	S	Q	L	F	N	A	G	S	Q	A	V	R	E	T	D	S	N	I	L	V	A	L	H	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T									S	S	S		S	S		B	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T	T	S						.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	N	P	E	T	S	G	R	Y	A	W	I	A	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	R	H	H	V	D	Y	D	V	F	A	S	S	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.												.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.														.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	W	H	G	T	L	K	N	L	T	S	V	L	T	S	V	A	D	T	Y	G	K	K	V	M	V	A	E	T	S	Y	T	Y	T	A	E	D	G	D	G	H	G	N	T	A	P	K	N	G	Q	T	L	N	N	P	V	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S																														S		S			S	S	S	S			S	S	S		T	T	S				S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																								235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.
Template Sequence		V	Q	G	Q	A	N	A	V	R	D	V	I	Q	A	V	S	D	V	.	.	.	G	E	A	G	I	G	V	F	Y	W	E	P	A	W	I	P	V	G	P	A	H	R	L	E	K	N	K	A	L	W	E	T	Y	G	S	G	W	A	T	S	Y	A	A	E	Y	D	P	E	D	A	G	K	W	F	G	G	S	A	V
Template Known Secondary structure																		T	T	.	.	.		T	T									T	T				S	S		G	G	G														S	S	B		G	G	G	T	T	T		T	T	T						B	S		S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310				.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V
Query Conservation
Alig confidence								.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	Q	A	L	F	.	.	D	F	K	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	P	S	L	H	V	F	Q	Y	V
Template Known Secondary structure		G	G	G		S	B	.	.		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	B		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure								.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380									.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.