Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 37 Aligned Residues 315 % Identity 14% Template d1ur1a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.43

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		K	S	A	Y	K	D	N	F	L	I	G	A	A	L	N	A	T	I	A	S	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	L	N	T	L	I	.	.	A	K	E	F	N	S	I	T	P
Template Known Secondary structure					T	T	T	T													T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.					S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.												50																													.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.			120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.			.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.																.	.
Query SS confidence																																									.	.																.	.
Query Sequence		R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	.	.	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	.	.	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V
Query Conservation																																									.	.																.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																	.	.																.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	C	M	K	W	G	V	L	R	D	A	Q	G	Q	W	N	W	.	.	.	.	.	K	D	A	D	A	F	V	A	F	G	T	K	H	N	L	H	M	V	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	I	H	D	E	V	F	K	N	A	D	G	S	Y	I	S	K	A	A	L	Q	K	K	M	E	E	H	I	T	T	L
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S					B		T	T			B			.	.	.	.	.													T	T											S	S	S	S		G	G	G	T	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.						.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	R	Y	K	G	K	L	A	A	W	D	V	V	N	E	A	V	G	D	D	L	K	M	R	D	S	H	W	Y	K	I	M	G	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	Y	N	A	F	T	L	A	N	E	V	D	P	K	A	H	L	M	Y	N	D	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T	T		S									B		T	T	S	S	B										T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.													.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	R	T	G	K	R	E	A	T	V	E	M	I	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	K	R	G	M	P	I	H	G	L	G	I	Q	G	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.												.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.																.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	I	Q	D	D	Y	R
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	T	P	P	I	A	E	I	E	K	S	I	I	A	F	.	A	K	L	G	L	R	V	H	F	T	S	L	D	V	D	V	L	P	S	V	W	E	E	V	S	T	R	F	E	Y	K	P	E	R	D	P	Y	T	K	G	L	P	Q	E	M	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		S													.		T	T	T													S							T	T	T	T	T	S			G	G	G		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
																		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.						.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	.	.	.	.	.	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K
Query Conservation																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	K	L	A	K	R	Y	E	D	L	F	K	L	F	I	K	H	S	D	K	I	D	R	A	T	F	W	G	V	S	D	D	A	S	W	L	N	G	F	P	I	P	G	.	R	T	N	Y	P	L	L	F	D	R	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	D	A	Y	F	R	L	L	D	L	K	R
Template Known Secondary structure																		T	T	T	T							S		S	B	G	G	G		G	G	G	T	S	S	S	T	T	.						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																													.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.											.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370