Job Description P11988 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 70 Aligned Residues 292 % Identity 17% Template d1uhva2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.10

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		65	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.						.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query SS confidence										.																																.	.	.	.	.																																	.	.	.
Query Sequence		Y	P	E	D	I	A	L	F	.	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	.	.	.	.	.	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	.	.	.
Query Conservation										.																																.	.	.	.	.																																	.	.	.
Alig confidence										.																																.	.	.	.	.																								.	.								.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.
Template Sequence		Y	I	E	T	L	K	Y	V	K	E	N	I	D	F	K	Y	I	R	G	H	G	L	L	C	D	D	V	G	I	Y	R	E	D	V	V	G	D	E	V	K	P	F	Y	N	F	T	Y	I	D	R	I	F	D	S	F	L	E	I	G	I	R	P	F	V	E	I	G	F	.	.	M	P	K	K	L	A	S	G	T	Q
Template Known Secondary structure											T	T	S								S		T	T	S	T	T	T									T	T																						T										.	.			T	T	T	B	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Template SS confidence
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.			.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
							136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.								.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	.	.	.	.	.	.	.	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L
Query Conservation		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.		.																										.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	F	Y	W	E	.	G	N	V	T	P	P	K	D	Y	E	K	W	S	D	L	V	K	A	V	L	H	H	F	I	S	R	Y	G	I	E	E	V	L	K	W	P	F	E	I	W	N	E	P	N	L	K	E	F	W	K	D	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	E	Y	F
Template Known Secondary structure				T	T	T	T	.				S		B	S																										T	T						S	S		T	T	S	T	T	T	S	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																.	.	.	.	.
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	Y	K	V	T	A	K	A	I	K	E	V	N	E	N	L	K	V	G	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	C	G	G	A	D	Y	W	I	E	D	F	L	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T		T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.							.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	.	.	.	.	.	.	Y	Q	K	P	L
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	C	Y	E	E	N	V	P	V	D	F	V	S	R	H	A	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	Q	G	E	Y	T	P	H	L	I	Y	Q	E	I	M	P	S	E	Y	M	L	N	E	F	K	T	V	R	E	I	I	K	N	S	H	F	P	N	L	P	F
Template Known Secondary structure		.					T				S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B							S	S						B																			T	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.				.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.
Query Sequence		F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	.	.	.	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D
Query Conservation																																																												.	.	.
Alig confidence													.	.	.																									.	.	.	.	.	.															.	.	.																			.
Template Conservation													.	.	.																									.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		H	I	T	E	Y	N	T	S	Y	S	P	.	.	.	Q	N	P	V	H	D	T	P	F	N	A	A	Y	I	A	R	I	L	S	E	G	G	D	Y	.	.	.	.	.	.	V	D	S	F	S	Y	W	T	F	S	D	V	F	E	E	R	D	V	P	R	S	Q	F	H	G	G	F	G	L	V	A	L	N	M	I	.
Template Known Secondary structure								S		S		T	.	.	.	T		G	G	G	G	S														G	G	G	T	.	.	.	.	.	.		S					S		S	B	S				T	T	S	S			S	S		S			S		S			T	T	T		.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.																									.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.				.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.							.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	T	F	Y	T	F	K	F	F	N	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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