Job Description P11988 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 59 Aligned Residues 272 % Identity 16% Template d1ta3b_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.70

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		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.			120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.
Query SS confidence																																																										.	.
Query Sequence		R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	.	.	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A
Query Conservation																																																										.	.
Alig confidence								.	.																												.	.	.	.	.																	.	.															.	.	.
Template Conservation								.	.																												.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Sequence		Q	N	E	A	I	V	.	.	A	S	Q	F	G	V	I	T	P	E	N	S	M	K	W	D	A	L	E	P	S	Q	G	N	F	G	W	.	.	.	.	.	S	G	A	D	Y	L	V	D	Y	A	T	Q	H	N	K	K	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	L	P	S	W	V	.	.	.	S	S	I	G	D
Template Known Secondary structure								.	.					S					S	S	T	T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T											S	S	S						.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure								.	.																												.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.				.	.	.	.	.
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Sequence		A	N	T	L	R	S	V	M	T	N	H	I	N	E	V	V	G	R	Y	K	G	K	I	M	H	W	D	V	V	N	E	I	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	G	T	F	R	N	S	V	F	Y	N	L	L	G	.	.	E	D	F	V	R	I	A	F	E	T	A	R	A	A	D	P	D	A	K
Template Known Secondary structure																				T	T	T	S		S							S		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	B										T	.	.	T															T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.											.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	I	N	D	Y	N	.	.	.	.	L	D	S	A	S	Y	A	K	T	Q	A	M	A	S	Y	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	W	L	A	E	G	V	P	I	D	G	I	G	S	Q	A	H	Y
Template Known Secondary structure							S		.	.	.	.				T	T	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.					.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	H	W	S	S	T	E	A	A	G	A	L	S	S	L	A	N	T	G	V	S	E	V	A	I	T	E	L	D	I	A	G	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T				G	G	G										T	T			S										T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	S	S	D	Y	L	N	L	L	N	A	C	L	N	E	Q	K	C	V	G	I	T	V	W	G	V	S	D	K	D	S	W	R	A	S	.	.	.	D	S	P	L	L	F	D	G	N	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	D	A	Y	N	A	I	V	N	A	L	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.													T		T	T							S		S	B	G	G	G	S	T	T	G	G	.	.	.	G			S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.				.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.											.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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