Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 426 % Identity 23% Template d1qvba_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.40

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		K	F	P	K	D	F	M	I	G	Y	S	S	S	P	F	Q	F	E	A	G	I	P	G	S	E	D	P	N	S	D	W	W	V	W	V	H	D	P	E	N	T	A	A	G	L	.	.	V	S	G	D	F	P	E	N	G	P	G	Y	W	N	L	N	Q	N	D	H	D	L	A	E	K	L	G	V	N	T	I	R	V
Template Known Secondary structure		B			T	T													S			S	T	T				T	T	B															T	S	.	.	S		S			G	G	G	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.			.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	E	W	S	R	I	F	P	K	P	T	F	N	V	K	V	P	V	E	R	D	E	N	G	S	I	V	H	V	D	V	D	D	K	A	V	E	R	L	D	E	L	A	N	K	E	A	V	N	H	Y	V	E	M	Y	K	D	W	V	E	R	G	R	K	L	I	L	N	L	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H
Template Known Secondary structure										S	S			T	T	S								T	T	S																			S																	T	T	T							S			S			B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		135	.	.												.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.				.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.
Query Sequence		K	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	.	.	.	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	I	M	V	R	R	M	G	P	D	R	A	P	S	G	W	L	N	E	E	S	V	V	E	F	A	K	Y	A	A	Y	I	A	W	K	M	G	E	L	P	V	M	W	S	T	M	N	E	P	N	V	V	Y	E	Q	G	Y	M	F	V	K	G	G	F	P	P	G	Y	L	S	L	E	A	A	D	K	A	R	R
Template Known Secondary structure											G	G	G	S		B	G	G	G	S	T																		T	T	S		S																	T		G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M
Query Conservation
Alig confidence																			.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	M	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	N	I	K	R	F	S	.	K	K	P	V	G	L	I	Y	A	F	Q	W	F	E	L	L	E	G	P	A	E	V	.	.	F	D	K	F	K	S	S	K	L	Y	Y	F	T	D	I	V	S	K	G	S	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I
Template Known Secondary structure																			.		S														S	S	S			S		.	.									T	S	T	T	T	T					S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																			.																							.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.					.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.
Query Sequence		T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	.	.	.	.	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P
Query Conservation																																														.	.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	E	Y	R	R	D	L	A	N	R	L	D	W	L	G	V	N	Y	Y	S	R	L	V	Y	K	I	V	D	D	K	P	I	I	L	H	G	Y	G	F	L	C	T	P	G	G	I	S	P	A	E	N	P	C	S	D	F	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	L	L	L	K	E	L	Y	N	R	Y	G	V	D
Template Known Secondary structure							T	T	T	S	S			S																T	T						T	T	S	G	G	G	S		T	T		B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.
Template Sequence		L	I	V	T	E	N	G	V	S	D	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	L	R	P	A	Y	L	V	S	H	V	Y	S	V	W	K	A	A	N	E	G	I	P	V	K	G	Y	L	H	W	S	L	T	D	N	Y	E	W	A	Q	G	.	F	R	Q	K	F	G	L	V	M	V	D	F	K	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S	S				S					T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.														.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.										.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G	L	S	L	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	T	K	K	R	Y	L	R	P	S	A	L	V	F	R	E	I	A	T	H	N	G	I	P	D	E
Template Known Secondary structure		.	.	T	T																		T	B			G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.