Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 445 % Identity 35% Template d1qoxa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.7

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	H	M	F	P	S	D	F	K	W	G	V	A	T	A	A	Y	Q	I	E	G	A	Y	N	E	D	G	R	G	M	S	I	W	D	T	F	A	H	.	.	.	.	.	.	T	P	G	K	V	K	N	G	D	N	G	N	V	A	C	D	S	Y	H	R	V	E	E	D	V	Q	L	L	K	D	L	G	V	K	V	Y
Template Known Secondary structure							T	T																T	T	S	T	T				B								.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	S	G	G	G			T	T	T	T	T		T	T	S													T		S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40							.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y
Query Conservation
Alig confidence															.																																											.
Template Conservation															.																																											.
Template Sequence		R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	Q	G	.	T	G	E	V	N	R	A	G	L	D	Y	Y	H	R	L	V	D	E	L	L	A	N	G	I	E	P	F	C	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	Q	.	G	G	W	G	S	R	I	T	I	D	A	F	A	E	Y	A	E	L	M	F	K	E	L
Template Known Secondary structure											S	T	T	S	.	S	S	S																			T	T									S	S			B					T	T	.	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure															.																																											.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q
Query Conservation																															.
Alig confidence																															.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	K	I	K	Q	W	I	T	F	N	E	P	W	C	M	A	F	L	S	N	Y	L	G	V	H	A	P	G	N	K	D	L	Q	L	A	I	D	V	S	H	H	L	L	V	A	H	G	R	A	V	T	L	F	R	E	L	G	I	S	G	E	I	G	I	A	P	N	T	S	W	A	V	P	Y	R	R	T	K	E
Template Known Secondary structure		T	T	T																			T	S		S	S	T	T																													T	T			S														S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	.	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N
Query Conservation															.
Alig confidence															.																																																											.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.
Template Sequence		D	M	E	A	C	L	R	V	N	G	W	S	G	D	W	Y	L	D	P	I	Y	F	G	E	Y	P	K	F	M	L	D	W	Y	E	N	L	G	Y	K	P	P	I	V	D	G	D	M	E	L	I	H	Q	P	I	D	F	I	G	I	N	Y	Y	T	S	S	M	N	R	Y	N	P	G	.	.	.	E	A	G	G	M
Template Known Secondary structure												T	T	T									T	S	S													T							T	T										S							S									S	S	.	.	.	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A
Query Conservation																																								.
Alig confidence																																								.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	S	E	A	I	S	M	G	A	P	K	T	D	I	G	W	E	I	Y	A	E	G	L	Y	D	L	L	R	Y	T	A	D	K	Y	G	N	P	T	L	Y	I	T	E	N	G	A	C	Y	N	D	G	L	S	L	D	G	R	I	H	D	Q	R	R	I	D	Y	L	A	M	H	L	I	Q	A	S	R	A	I	E
Template Known Secondary structure		T	T										B		T	T	S		B			T														T	T	S																		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G	L	S	L
Query Conservation
Alig confidence																								.														.	.	.	.	.
Template Conservation																								.														.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	I	N	L	K	G	Y	M	E	W	S	L	M	D	N	F	E	W	A	E	G	.	Y	G	M	R	F	G	L	V	H	V	D	Y	D	.	.	.	.	.	T	L	V	R	T	P	K	D	S	F	Y	W	Y	K	G	V	I	S	R	G	W	L	D	L
Template Known Secondary structure		T	T											S	B					G	G	G	T	.	T	S	S				S					T	T	.	.	.	.	.	T	T																		S
Template Predicted Secondary structure																								.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.						.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450