Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 440 % Identity 35% Template d1pbga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.		.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		M	K	A	.	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C
Query Conservation					.
Alig confidence					.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	T	K	T	L	P	K	D	F	I	F	G	G	A	T	A	A	Y	Q	A	E	G	A	T	H	T	D	G	K	G	P	V	A	W	D	K	Y	L	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	W	Y	T	A	E	P	A	S	D	F	Y	H	K	Y	P	V	D	L	E	L	A	E	E	Y	G	V	N	G
Template Known Secondary structure								T	T																T	T	S	T	T				B								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S			S	S	S	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40											.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R
Query Conservation
Alig confidence																.																																											.
Template Conservation																.																																											.
Template Sequence		I	R	I	S	I	A	W	S	R	I	F	P	T	G	.	Y	G	E	V	N	E	K	G	V	E	F	Y	H	K	L	F	A	E	C	H	K	R	H	V	E	P	F	V	T	L	H	H	F	D	T	P	E	A	L	H	S	N	.	G	D	F	L	N	R	E	N	I	E	H	F	I	D	Y	A	A	F	C	F	E	E
Template Known Secondary structure												S	T	T	S	.	S	S	S																				T									S	S			B						T	.	T	G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure																.																																											.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.
Predicted Secondary structure																																.	.																																															.
Query SS confidence																																.	.																																															.
Query Sequence		Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	.	C
Query Conservation																																.	.																																															.
Alig confidence					.																											.	.																																															.
Template Conservation					.
Template Sequence		F	P	E	.	V	N	Y	W	T	T	F	N	E	I	G	P	I	G	D	G	Q	Y	L	V	G	K	F	P	P	G	I	K	Y	D	L	A	K	V	F	Q	S	H	H	N	M	M	V	S	H	A	R	A	V	K	L	Y	K	D	K	G	Y	K	G	E	I	G	V	V	H	A	L	P	T	K	Y	P	Y	D	P	E
Template Known Secondary structure			T	T	.								S											T	S			S	T	T				S																										T	T		S	S														S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		149	150	.		.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.					270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.																							.	.	.	.																				.	.	.
Query SS confidence													.																							.	.	.	.																				.	.	.
Query Sequence		Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	.	.	.	.	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	.	.	.	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D
Query Conservation													.																							.	.	.	.																				.	.	.
Alig confidence													.																							.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	A	D	V	R	A	A	E	L	E	D	I	I	H	N	K	F	I	L	D	A	T	Y	L	G	H	Y	S	D	K	T	M	E	G	V	N	H	I	L	A	E	N	G	G	E	L	D	L	R	D	E	D	F	Q	A	L	D	A	A	K	D	L	N	D	F	L	G	I	N	Y	Y	M	S	D	W	M	Q	A	F
Template Known Secondary structure																	T									T	S	S																																		T	T										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.			.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.
Query SS confidence																																																.	.
Query Sequence		E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	.	.	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N
Query Conservation																																																.	.
Alig confidence				.																																												.	.																	.
Template Conservation				.																																																														.
Template Sequence		D	G	.	E	T	E	I	I	K	Y	Q	I	K	G	V	G	R	R	V	A	P	D	Y	V	P	R	W	I	I	Y	P	E	G	L	Y	D	Q	I	M	R	V	K	N	D	Y	P	N	Y	K	K	I	Y	I	T	E	N	G	L	G	Y	K	D	E	F	.	V	D	N	T	V	Y	D	D	G	R	I	D	Y	V	K
Template Known Secondary structure				.			B		.					T	T	T							T	T			.					T															T	T													B					.		T	T
Template Predicted Secondary structure				.																																																														.
Template SS confidence
		308	.		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G	L	S
Query Conservation
Alig confidence																																			.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.														.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	H	L	E	V	L	S	D	A	I	A	D	G	A	N	V	K	G	Y	F	I	W	S	L	M	D	V	F	S	W	S	N	G	.	Y	E	K	R	Y	G	L	F	Y	V	D	F	D	.	.	.	.	.	T	Q	E	R	Y	P	K	K	S	A	H	W	Y	K	K	L	A	E	T	Q	V	I	E
Template Known Secondary structure													T	T											S	B				B	T	T	T	B	.	T	T	S	B			S					T	T	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.		.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.						.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.