Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 292 % Identity 18% Template d1nq6a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.78

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		A	A	K	G	R	Y	F	G	A	A	V	A	A	N	H	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	Y	A	S	T	L	D	A	Q	.	.	F	G	S	V	T	P	E	N	E
Template Known Secondary structure			T	T	T									G	G	G	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.		S					S	S	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	30	.	.	.	.	.	.			.	.	.	40	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	.	.	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	W	D	A	V	E	S	S	R	N	S	F	S	F	.	.	.	.	.	S	A	A	D	R	I	V	S	H	A	Q	S	K	G	M	K	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	L	P	G	W	V	.	.	.	.	S	P	L	A	A	T	D	L	R	S	A	M	N	N	H	I	T	Q	V	M	T	H	Y	K
Template Known Secondary structure		T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.														T											S	T	T			T	T	T	.	.	.	.	T	T	S																				T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.					.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	I	H	S	W	D	V	V	N	E	A	F	Q	D	G	G	S	G	A	R	R	S	S	P	F	Q	D	K	L	G	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	E	E	A	F	R	T	A	R	T	V	D	A	D	A	K	L	C	Y	N	D	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S		S									B		S	S	S				B											T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.											150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	G	Q	N	A	K	S	N	A	V	Y	E	M	V	K	D	F	K	Q	R	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	C	V	G	F	Q	S	H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S																	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.															.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	N	S	P	V	P	S	D	F	Q	A	N	L	Q	R	F	.	A	D	L	G	V	D	V	Q	I	T	E	L	D	I	E	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	A	Q	A	A	N	Y	T	K	V	V	.	.	.	.	N	A	C	L	A	V	T	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T	B				T	T									.		T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.					T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
													208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.											.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.					.	.	.	.	.	.	260	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	T	G	I	T	V	W	G	V	T	D	K	Y	S	W	R	S	G	.	.	.	G	T	P	L	L	F	D	G	D	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	P	A	Y	D	A	V	L	A	A	L
Template Known Secondary structure								S		S		G	G	G		T	T	G	G	.	.	.	G			S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.				280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290											.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.