Job Description P11988 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 288 % Identity 17% Template d1hjqa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.55

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.				.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.																		.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.																		.	.
Query Sequence		I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	.	.	.	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.																		.	.
Alig confidence																		.		.	.										.	.	.	.	.																									.	.	.											.							.	.
Template Conservation																		.		.	.										.	.	.	.	.																																						.
Template Sequence		E	Y	I	L	A	E	N	G	V	N	M	V	R	Q	R	V	.	W	.	.	V	N	P	W	D	G	N	Y	N	.	.	.	.	.	L	D	Y	N	I	Q	L	A	R	R	A	K	A	A	G	L	G	L	Y	I	N	F	H	Y	S	D	T	W	A	D	P	A	H	Q	T	T	P	.	A	G	W	P	S	D	I	N
Template Known Secondary structure								T	T									.		.	.	S	S		T	T		T	T	S	.	.	.	.	.														T	T										S	S	S			B	T	T	B		B			.	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																		.		.	.										.	.	.	.	.																																						.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.			50	.	.	.	.	.	.	.	.						.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.		.	.	.	.	100	.	.	.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	.	.	.	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence																			.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		N	L	A	W	K	L	Y	N	Y	T	L	D	S	M	N	R	F	A	D	A	G	I	Q	V	D	I	V	S	I	G	N	E	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	L	L	W	P	L	G	K	T	N	N	W	Y	N	.	.	.	.	I	A	R	L	L	H	S	A	A	W	G	V	K	D	S	R	L	N	P
Template Known Secondary structure																						T									S	S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B	S	S	B	T	T	T	B	T	T					.	.	.	.														T	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.									.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.					.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence												.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	P	K	I	M	V	H	L	D	N	.	.	G	W	N	W	D	T	Q	N	W	W	Y	T	N	V	L	S	Q	G	P	F	E	M	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	M	M	G	V	S	F	Y
Template Known Secondary structure										S		.	.	T	T																S	S	S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	210	.	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	Y	S	A	S	A	T	L	D	S	L	R	R	S	L	N	N	M	V	S	R	W	G	K	E	V	A	V	V	E	T	N	W	P	T	S	C	P	Y	P	R	Y	Q	F	P	A	D	V	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T		T	T																														S	B		S	S		S	S				G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		381					.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.
Query Sequence		R	.	.	.	.	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V
Query Conservation			.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	P	F	S	A	A	G	Q	T	Q	Y	I	Q	S	V	A	N	V	V	S	S	V	S	K	G	V	G	L	F	Y	W	E	P	A	W	I	H	N	A	N	L	G	S	S	C	A	D	N	T	M	F	T	P	S	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	S	S	L	S	V	F	H	R	I
Template Known Secondary structure		T	S		S	S																		S	T	T									T	T		G	G	G	T	T	T	T	S	S	S	S	B			S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.											.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions