Job Description P11988 Confidence 99.66% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 89 Aligned Residues 244 % Identity 12% Template d1egza_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 2.30

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		66	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		P	E	D	I	A	L	F	A	.	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A
Query Conservation										.
Alig confidence										.															.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	T	V	A	S	L	K	K	D	W	K	S	S	I	V	R	A	A	M	G	V	Q	.	.	.	E	S	G	G	Y	L	Q	D	P	A	G	N	K	A	K	V	E	R	V	V	D	A	A	I	A	N	D	M	Y	A	I	I	G	W	H	S	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	N
Template Known Secondary structure											T	T												S	.	.	.	S	T	T	S	T	T	T																			T	T										S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.				.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.														.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	.	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G
Query Conservation																					.
Alig confidence																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		N	R	S	E	A	I	R	F	F	Q	E	M	A	R	K	Y	G	N	K	P	N	V	I	Y	E	I	Y	N	E	P	L	Q	V	S	W	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	K	P	Y	A	E	A	V	I	S	A	I	R	A	I	D	P	D	N	L	I	.
Template Known Secondary structure		G																T	T	S	T	T							S				S			T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																	S	S	S			.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	G	T	P	S	W	S	Q	N	V	D	E	A	S	R	D	P	I	N	A	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	Y	T	L	H	F	Y	A	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T							T	S				S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
																																				164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.													.	.	.	190	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	H	G	E	S	L	R	N	K	A	R	Q	A	L	N	.	N	G	I	A	L	F	V	T	E	W	G	T	V	N	A	D	G	.	.	.	.	.	.	.	N	G	G	V	N	Q	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T															.	T	T										S	S		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.		.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.								.	230	.	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.						.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.						.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	D	A	W	V	T	F	M	.	.	.	R	D	N	N	I	.	.	.	S	N	A	N	W	A	L	N	D	K	N	E	G	A	S	T	.	Y	Y	P	D	.	.	.	.	.	.	S	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	E	S	G	K	K	V	K	S	I	I	Q	S
Template Known Secondary structure											.	.	.			T	T		.	.	.										S	S	S	T	T		S	.	B		T	T	.	.	.	.	.	.	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B													T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.						.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.				.	.	.	.	.				250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.							270	.	.											.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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