Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 441 % Identity 27% Template d1e4mm_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.2

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		S	S	F	S	S	D	F	I	F	G	V	A	S	S	A	Y	Q	I	E	G	T	I	.	.	.	G	R	G	L	N	I	W	D	G	F	T	H	R	Y	.	.	.	.	P	N	K	S	G	P	D	H	G	N	G	D	T	T	C	D	S	F	S	Y	W	Q	K	D	I	D	V	L	D	E	L	N	A	T	G	Y	R
Template Known Secondary structure		G	G	S		T	T													S		S	T	.	.	.	T	S			B									S	.	.	.	.						T	T				S	S	S	T	T																	T		S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.				.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.					.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	.	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y
Query Conservation															.
Alig confidence															.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	I	A	W	S	R	I	I	P	R	G	K	R	S	R	G	V	N	E	K	G	I	D	Y	Y	H	G	L	I	S	G	L	I	K	K	G	I	T	P	F	V	T	L	F	H	W	D	L	P	Q	T	L	Q	D	E	Y	E	G	F	L	D	P	Q	I	I	D	D	F	K	D	Y	A	D	L	C	F	E	E	F
Template Known Secondary structure											T	T	S	S	G	G	G																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190														.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.			.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Query Sequence		Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	.	.	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	S	V	K	Y	W	L	T	I	N	Q	L	Y	S	V	P	T	R	G	Y	G	S	A	L	D	A	P	G	R	C	S	P	T	V	D	P	S	C	Y	A	G	N	S	S	T	E	P	Y	I	V	A	H	H	Q	L	L	A	H	A	K	V	V	D	L	Y	R	K	N	Y	T	H	Q	G	G	K	I	G	P	T
Template Known Secondary structure		T	T	T								S		T	T								T	S		S	S	T	T					T	T	T		T	T		S	S			T	T	T																								S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.			.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.																												.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		M	I	T	R	W	F	L	P	Y	N	D	T	D	R	H	S	I	A	A	T	E	R	M	K	E	F	F	L	G	W	F	M	G	P	L	T	N	G	T	Y	P	Q	I	M	I	D	T	V	G	E	R	.	.	L	P	S	F	S	P	E	E	S	N	L	V	K	G	S	Y	D	F	L	G	L	N	Y	Y	F	T	Q
Template Known Secondary structure										S	S	T	T																T										S	S										G	G	G	.	.	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.			.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query Sequence		C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	I	V	E	N	G	L	G
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	Q	P	S	P	N	P	V	N	S	T	N	H	T	A	M	M	D	A	G	A	K	L	T	Y	I	N	A	S	G	H	Y	I	G	P	L	F	E	K	D	K	A	D	S	T	D	N	I	Y	Y	Y	P	K	G	I	Y	S	V	M	D	Y	F	K	N	K	Y	Y	N	P	L	I	Y	V	T	E	N	G	I	S
Template Known Secondary structure										T	T	S	T	T			G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B		S	S						S	S		G	G	G						T														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	.	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R
Query Conservation																																		.
Alig confidence																																		.																							.																.	.	.	.
Template Conservation																																																									.																.	.	.	.
Template Sequence		T	P	G	D	E	N	R	N	Q	S	M	L	D	Y	T	R	I	D	Y	L	C	S	H	L	C	F	L	N	K	V	I	K	E	K	D	V	N	V	K	G	Y	L	A	W	A	L	G	D	N	Y	E	F	N	K	G	.	F	T	V	R	F	G	L	S	Y	I	D	W	N	N	V	.	.	.	.	T	D	R	D	L
Template Known Secondary structure				T	T	S																																									S	B				B	T	T	T	B	.	T	S					S					T	T			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.																.	.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.					.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	K	S	G	Q	W	Y	Q	S	F	I	S
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500