Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 444 % Identity 31% Template d1cbga_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.15

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		1	.	.			.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.
Query SS confidence					.	.
Query Sequence		M	K	A	.	.	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T
Query Conservation					.	.
Alig confidence					.	.																																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	R	S	C	F	A	P	G	F	V	F	G	T	A	S	S	A	F	Q	Y	E	G	A	A	F	E	D	G	K	G	P	S	I	W	D	T	F	T	H	K	Y	.	.	.	.	.	P	E	K	I	K	D	R	T	N	G	D	V	A	I	D	E	Y	H	R	Y	K	E	D	I	G	I	M	K	D	M	N	L	D
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G	S		T	T																S	S	S	T	T				B										.	.	.	.	.	G	G	G	S	T	T				S	S	S	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.						.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	.	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F
Query Conservation																		.
Alig confidence																		.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	K	G	K	L	S	G	G	V	N	R	E	G	I	N	Y	Y	N	N	L	I	N	E	V	L	A	N	G	M	Q	P	Y	V	T	L	F	H	W	D	V	P	Q	A	L	E	D	E	Y	R	G	F	L	G	R	N	I	V	D	D	F	R	D	Y	A	E	L	C	F
Template Known Secondary structure													S	T	T	S	S	G	G	G																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.														190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.				.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query Sequence		T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	.	.	.	L	P	E	A	K
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	F	G	D	R	V	K	H	W	I	T	L	N	E	P	W	G	V	S	M	N	A	Y	A	Y	G	T	F	A	P	G	R	C	S	D	W	L	K	L	N	C	T	G	G	D	S	G	R	E	P	Y	L	A	A	H	Y	Q	L	L	A	H	A	A	A	A	R	L	Y	K	T	K	Y	Q	A	S	Q	N	G	I
Template Known Secondary structure					T	T	T																			T	S			S	T	T					G	G	G		S			S	S			T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure																												.
Query SS confidence																												.
Query Sequence		I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y
Query Conservation																												.
Alig confidence																												.																												.	.
Template Conservation																																																								.	.
Template Sequence		I	G	I	T	L	V	S	H	W	F	E	P	A	S	K	E	K	A	D	V	D	A	A	K	R	G	L	D	F	M	L	G	W	F	M	H	P	L	T	K	G	R	Y	P	E	S	M	R	Y	L	V	R	K	R	.	.	L	P	K	F	S	T	E	E	S	K	E	L	T	G	S	F	D	F	L	G	L	N	Y	Y
Template Known Secondary structure														S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	S												T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.			.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.									.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.		.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.													.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.													.	.
Query Sequence		M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	.	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.													.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																				.																						.													.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	Y	Y	A	A	K	A	P	R	I	P	N	A	R	P	A	I	Q	T	D	S	L	I	N	A	T	F	E	H	N	G	K	P	L	G	P	M	A	A	S	S	W	L	C	I	Y	P	Q	G	I	R	K	L	L	L	Y	V	K	N	H	Y	N	N	P	V	I	Y	I	T	E	N	G	R	N	E	F	N	D	P
Template Known Secondary structure													T	T									T						S			T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T														T	T																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F
Query Conservation
Alig confidence																																																					.																.	.	.	.
Template Conservation																																																					.																.	.	.	.
Template Sequence		T	L	S	L	Q	E	S	L	L	D	T	P	R	I	D	Y	Y	Y	R	H	L	Y	Y	V	L	T	A	I	G	D	G	V	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	F	D	N	M	E	W	D	S	G	.	Y	T	V	R	F	G	L	V	F	V	D	F	K	N	N	.	.	.	.	L	K	R	H	P	K	L	S	A
Template Known Secondary structure		T	S																												T	T									S		S	B					G	G	G	T	.	T	S					S					T	T	T	T	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.																.	.	.	.
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.		.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.					.	.	.	.	.	.	.	480	.
		449	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	W	Y	A	E	V	I	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		H	W	F	K	S	F	L	K
Template Known Secondary structure								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.