Job Description P11988 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 287 % Identity 21% Template d1bg4a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.75

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		E	T	F	L	W	.	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I
Query Conservation							.
Alig confidence							.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		H	G	K	K	Y	L	G	T	I	G	D	Q	Y	T	L	T	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	N	P	A	I	I	K	.	.	A	D	F	G	Q	L	T	P	E	N	S	M
Template Known Secondary structure		T	T		S													S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S								.	.				S					S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30																																									.	.	.	.	.	.	.	.			.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120			.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	.	.	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																		.	.																	.			.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.																																				.			.	.
Template Sequence		K	W	D	A	T	E	P	N	R	G	Q	F	T	F	.	.	.	.	.	S	G	S	D	Y	L	V	N	F	A	Q	S	N	G	K	L	I	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	L	P	G	W	V	S	S	I	.	T	D	.	.	K	N	T	L	I	S	V	L	K	N	H	I	T	T	V	M	T	R	Y	K	G
Template Known Secondary structure		S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T											S	S	S							T		.			.	.																			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.																																				.			.	.
Template SS confidence
		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.						.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.		100	.			.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	Y	A	W	D	V	L	N	E	I	F	N	E	D	G	S	L	R	N	S	V	F	Y	N	V	I	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	R	I	A	F	E	T	A	R	S	V	D	P	N	A	K	L	Y	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		S							S		B		T	T	S	S	B									T		T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.													.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	N	L	D	S	A	G	Y	S	K	V	N	G	M	V	S	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	W	L	A	A	G	I	P	I	D	G	I	G	S	Q	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S				S	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.						T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.									.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	A	G	A	G	S	A	V	A	G	A	L	N	A	L	A	S	A	G	T	K	E	I	A	I	T	E	L	D	I	A	G	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	D	Y	V	N	V	V	N	A	C	L	N	Q	A	K	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T		G	G	G										T	T			S										T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	G	I	T	V	W	G	V	A	D	P	D	S	W	R	S	S	.	.	.	S	S	P	L	L	F	D	G	N	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	A	A	Y	N	A	I	A	N	A	L
Template Known Secondary structure							S		S	B	G	G	G		T	T	G	G	.	.	.	G			S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.				280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290											.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.