Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 41 Aligned Residues 307 % Identity 14% Template c3emzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase xynb from paenibacillus2 barcinonensis complexed with a conduramine derivative Resolution 2.08 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	Y	A	N	S	F	K	I	G	A	A	V	H	T	R	M	L	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	E	F	I	A	K	H	Y	N	S	V	T	A	E
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	T															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S					S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																										.	.																.	.
Query SS confidence																																										.	.																.	.
Query Sequence		I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	.	.	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	.	.	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F
Query Conservation																																										.	.																.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																			.	.																.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Q	M	K	F	E	E	V	H	P	R	E	H	E	Y	T	F	.	.	.	.	.	E	A	A	D	E	I	V	D	F	A	V	A	R	G	I	G	V	R	G	H	T	L	V	W	H	N	Q	T	P	A	W	M	F	E	D	A	S	G	G	T	A	S	R	E	M	M	L	S	R	L	K	Q	H	I	D	T	V	V
Template Known Secondary structure		S	T	T	S						S	B	T	T	B				.	.	.	.	.												T	T	T								S	B		S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.						.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	Y	K	D	Q	I	Y	A	W	D	V	V	N	E	A	I	E	D	K	T	D	L	I	M	R	D	T	K	W	L	R	L	L	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	V	Q	A	F	N	M	A	H	E	A	D	P	N	A	L	L	F	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	N	E	T
Template Known Secondary structure				T	T	T	T		S									B		S	S	T	T			B									T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S						.	.	.	.	.	.	.		S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.											.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.								.	.	180	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	V	K	R	E	K	I	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	R	S	L	L	D	Q	G	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	G	I	G	M	Q	G	H	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.															.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370			.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.
Query SS confidence																																																							.	.
Query Sequence		N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	.	.	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A
Query Conservation																																																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																					.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	H	G	P	S	M	D	E	I	R	Q	A	I	E	R	Y	.	A	S	L	D	V	Q	L	H	V	T	E	L	D	L	S	V	F	R	H	E	D	Q	R	T	D	L	T	E	P	T	A	E	M	A	E	L	Q	Q	K	R	Y	E	D	I	F	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	B	S													.		T	T	S												S	S		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
																	214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230		.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		396		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.						.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure			.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		I	.	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y
Query Conservation			.																										.	.	.	.	.
Alig confidence			.																								.		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	E	Y	R	S	N	I	T	S	V	T	F	W	G	V	A	D	N	Y	T	W	L	D	N	.	F	P	V	R	G	R	K	N	W	P	F	V	F	D	T	E	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	D	S	F	W	R	I
Template Known Secondary structure					T	T	T	T							S	S	S	S	T	T			G	G	G	S	.	S	S	S	T	T						S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																											.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320											.	.	.	.	.	.	.	.