Job Description P11988 Confidence 99.63% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 91 Aligned Residues 320 % Identity 14% Template c2w5fB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase y; PDBTitle: high resolution crystallographic structure of the2 clostridium thermocellum n-terminal endo-1,4-beta-d-3 xylanase 10b (xyn10b) cbm22-1-gh10 modules complexed with4 xylohexaose Resolution 1.90 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Sequence		Y	A	N	Y	F	R	V	G	S	V	L	N	S	G	T	V	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	I	K	A	.	.	L	I	L	R	E	F	N	S	I	T	C	E	N	E
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									T	T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.							S					S	S	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	220	.			.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.							.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120			.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.						.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																											.	.														.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.																											.	.														.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	.	.	.	.	.	.	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	.	.	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	.	.	.	.	.	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E
Query Conservation													.	.	.	.	.	.																											.	.														.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.															.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	P	D	A	T	L	V	Q	S	G	S	T	N	T	N	I	R	V	S	L	N	R	A	.	.	.	.	.	A	S	I	L	N	F	C	A	Q	N	N	I	A	V	R	G	H	T	L	V	W	H	S	Q	T	P	Q	W	F	F	K	D	N	F	Q	D	N	G	N	W	V	S	Q	S	V	M	D	Q	R	L	E
Template Known Secondary structure		T	S												T	T							T	T	T	.	.	.	.	.										T	T											S	S	S			G	G	G	G	B	T	T	S	S	T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.						260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.						.	.	.	.	.	.	170	.	.	.				.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	220	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.											.	.	.																																														.
Query SS confidence															.	.	.	.	.											.	.	.																																														.
Query Sequence		H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	.	.	.	.	.	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	.	.	.	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	.	E	A	K
Query Conservation															.	.	.	.	.											.	.	.																																														.
Alig confidence															.	.	.	.	.											.	.	.																																														.
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	I	K	N	M	F	A	E	I	Q	R	Q	Y	P	S	L	N	L	Y	A	Y	D	V	V	N	A	A	V	S	D	D	A	N	R	T	R	Y	Y	G	G	A	R	E	P	G	Y	G	N	G	R	S	P	W	V	Q	I	Y	G	D	N	K	F	I	E	K	A	F	T	Y	A	R	K	Y	A	P	A	N	C	K
Template Known Secondary structure																T	T	S										S		B		S								S	T	T	B			B	S	S	B	T	T	B	B							S	S	T	T													S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	Y	N	D	Y	N	E	.	.	.	.	Y	W	D	H	K	R	D	C	I	A	S	I	C	A	N	L	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	L	L	D	G	V	G	M	Q	S	H	I
Template Known Secondary structure							S	S	T	.	.	.	.	T	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.					.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	D	M	N	G	F	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	N	Y	K	A	A	L	Q	K	Y	.	I	N	I	G	C	D	V	Q	I	T	E	L	D	I	S	T	E	N	G	K	F	.	.	.	.	.	S	L	Q	Q	Q
Template Known Secondary structure			S		S	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.				S	S												T	T	T	T	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470						.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.			.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.
Query SS confidence																						.	.
Query Sequence		I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	.	.	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R
Query Conservation																						.	.
Alig confidence																						.	.																			.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	K	Y	K	A	V	F	Q	A	A	V	D	I	N	R	T	S	S	K	G	K	V	T	A	V	C	V	W	G	P	N	D	A	N	T	W	L	G	S	.	.	Q	N	A	P	L	L	F	N	A	N	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	A	Y	N	A	V	A	S	I	I	P	Q	S
Template Known Secondary structure																					S	S								S	S	S	S	T	T	S		T	T		G	.	.	G	G			S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B									T	S	S		G	G
Template Predicted Secondary structure																																										.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.			.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.											.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.