Job Description P11988 Confidence 96.38% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 149 Aligned Residues 198 % Identity 18% Template c2vx6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cellvibrio japonicus mannanase cjman26c; PDBTitle: cellvibrio japonicus mannanase cjman26c gal1man4-bound form Resolution 1.57 Å

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		106	.	.	.	110	.	.	.	.				.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.												.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	R	L	F	D	E	M	A	.	.	.	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	.	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.				.	.							.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.																																																		.
Template Sequence		F	E	K	M	Q	H	W	I	K	A	G	Y	S	R	G	.	.	G	V	I	T	I	S	W	H	V	F	N	P	V	S	G	G	N	S	W	D	K	T	P	A	V	H	E	L	I	P	G	G	A	R	H	A	T	L	K	A	Y	L	D	T	F	V	A	F	N	.	E	G	L	A	D	V	D	A	Q	G	N	K	H
Template Known Secondary structure															T	T	.	.												T	T	T	S			T	T										S	T	T	S	T	T																.		T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.																																																		.
Template SS confidence
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.			.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
			164	.		.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure		.			.																											.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.			.																											.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	V	A	.	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	.	.	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.			.																											.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.			.										.	.	.	.	.	.	.	.										.	.										.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	P	I	I	F	R	P	W	H	E	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	W	F	W	W	G	K	G	H	A	S	E	Q	D	Y	I	A	L	W	.	.	.	.	.	.	R	F	T	V	H	Y	L	R	D	E	K	K	L	R	N	L	I	Y	A	Y	S	P	D	R	S	R	I	D	M	A	N	F	E
Template Known Secondary structure										S		S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	T	T	S	B	T	T	B										.	.	.	.	.	.									T	T	S				S								B	G	G	G	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.									.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.							.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
								232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	Y	L	Y	G	Y	P	G	D	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	I	I	G	L	D	N	Y	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T				G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S								.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	290	.	.	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.				.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.
Query Sequence		S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	.	.	.	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I
Query Conservation																																																		.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	V	G	H	E	A	N	T	A	S	A	D	E	Q	K	A	A	L	T	A	S	L	K	Q	L	V	Q	I	A	R	S	K	G	K	I	A	A	L	T	E	T	G	N	N	R	L	T	I	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T		T	T			S																								T											T	T			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G
Query Conservation
Alig confidence		.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	F	W	T	E	R	L	L	G	P	I	S	A	D	A	D	A	S	E	I	A	Y	V	M	V	W	R
Template Known Secondary structure		.					T	T						T	S	T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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