Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 441 % Identity 29% Template c2rgmA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase Resolution 1.55 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	F	P	K	R	F	V	F	G	T	V	T	S	A	Y	Q	V	E	G	M	A	A	S	G	G	R	G	P	S	I	W	D	A	F	A	H	.	.	.	.	.	.	T	P	G	N	V	A	G	N	Q	N	G	D	V	A	T	D	Q	Y	H	R	Y	K	E	D	V	N	L	M	K	S	L	N	F	D	A	Y	R
Template Known Secondary structure		G	G	S		T	T																T	T	S	T	T				B							T	.	.	.	.	.	.	S	T	T	S	S	G	G	G			S	S	S	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.							50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q
Query Conservation
Alig confidence														.
Template Conservation														.
Template Sequence		F	S	I	S	W	S	R	I	F	P	D	G	.	E	G	R	V	N	Q	E	G	V	A	Y	Y	N	N	L	I	N	Y	L	L	Q	K	G	I	T	P	Y	V	N	L	Y	H	Y	D	L	P	L	A	L	E	K	K	Y	G	G	W	L	N	A	K	M	A	D	L	F	T	E	Y	A	D	F	C	F	K	T	F	G
Template Known Secondary structure										S	T	T	S	.	S	S																				T	T									S	S			B									G	G	G	S	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.										.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.				.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query Sequence		H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	.	.	.	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	V	K	H	W	F	T	F	N	E	P	R	I	V	A	L	L	G	Y	D	Q	G	T	N	P	P	K	R	C	T	K	C	A	A	G	G	N	S	A	T	E	P	Y	I	V	A	H	N	F	L	L	S	H	A	A	A	V	A	R	Y	R	T	K	Y	Q	A	A	Q	Q	G	K	V	G	I	V	L	D	F	N
Template Known Secondary structure		T	T																			T	S			S	T	T				T	T		T	T				T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	.	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																												.	.
Template Conservation																																																.	.
Template Sequence		W	Y	E	A	L	S	N	S	T	E	D	Q	A	A	A	Q	R	A	R	D	F	H	I	G	W	Y	L	D	P	L	I	N	G	H	Y	P	Q	I	M	Q	D	L	V	K	D	R	.	.	L	P	K	F	T	P	E	Q	A	R	L	V	K	G	S	A	D	Y	I	G	I	N	Q	Y	T	A	S	Y	M	K	G	Q
Template Known Secondary structure						S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	.	.	S												T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.			.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		309	310	.	.										.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.
Query Sequence		E	S	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	.	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	M	Q	Q	T	P	T	S	Y	S	A	D	W	Q	V	T	Y	V	F	A	K	N	G	K	P	I	G	P	Q	A	N	S	N	W	L	Y	I	V	P	W	G	M	Y	G	C	V	N	Y	I	K	Q	K	Y	G	N	P	T	V	V	I	T	E	N	G	M	D	Q	P	A	N	L	S	R	D	Q	Y	L	R	D
Template Known Secondary structure															T									T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T														T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T
Query Conservation
Alig confidence																																											.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.														.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	R	V	H	F	Y	R	S	Y	L	T	Q	L	K	K	A	I	D	E	G	A	N	V	A	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	L	S	G	.	Y	T	S	K	F	G	I	V	Y	V	D	F	N	.	.	.	.	.	T	L	E	R	H	P	K	A	S	A	Y	W	F	R	D	M	L	K	H
Template Known Secondary structure																					T	T											S	B					G	G	G	G	.	G	G					S					T	T	.	.	.	.	.	T																T
Template Predicted Secondary structure																																											.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.		.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.						.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.