Job Description P11988 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 77 Aligned Residues 251 % Identity 16% Template c2oylB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:endoglycoceramidase ii; PDBTitle: endo-glycoceramidase ii from rhodococcus sp.: cellobiose-like2 imidazole complex Resolution 1.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.																.	.	.	130
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	V	T	L	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	M	P
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.
Template Sequence		A	D	L	A	R	E	Y	A	D	M	G	T	N	F	V	R	F	L	I	S	W	R	S	V	E	P	A	.	.	P	G	V	Y	D	Q	Q	Y	L	D	R	V	E	D	R	V	G	W	Y	A	E	R	G	Y	K	V	M	L	D	M	H	Q	D	V	Y	S	G	A	I	T	P	G	A	G	A	I	G	N	G	A	P
Template Known Secondary structure																											S	B	.	.	T	T	B																			T	T										B	S	S		G	G	G						S	S	S	B	S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.			.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.			.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	.	.	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence								.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.																																																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	A	T	Y	M	.	D	G	L	P	V	E	P	Q	P	R	W	E	L	Y	Y	I	Q	P	G	V	M	R	A	F	D	N	F	W	N	T	T	G	K	H	P	E	L	V	E	H	Y	A	K	A	W	R	A	V	A	D	R	F	A	D	N	D	A	V	V	A	Y	D	L	M	N	E	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G				.	T	T							S	S	G	G	G	G	G	G	S											T	T	S	S	S	S		T																		T	T		T	T								S	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.																																																																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.		.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	F	G	G	S	L	Q	G	P	A	F	E	A	G	P	L	A	A	M	Y	Q	R	T	T	D	A	I	R	Q	V	D	Q	D	T	W	V	C	V	A	P	Q	A	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.				T	T			T					T	T														T	T	T		S	S	S								S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	Q	G	L	P	S	G	L	T	K	I	D	D	P	R	A	G	Q	Q	R	I	A	Y	C	P	H	L	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	L	D	H	E	G	L	A	R	T	L	T	D	V	T	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T												S	S	S	S								B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	R	A	N	T	A	H	T	A	R	V	L	G	D	V	P	I	I	L	G	E	F	G	L	D	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	G	A	R	D	Y	I	E	R	V	Y	G	T	A	R	E	M	.	.	.	.	.	.	G	A	G	V	S	Y	W	S	S
Template Known Secondary structure														T	T	S			B				B					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T																.	.	.	.	.	.	T						S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.											.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.							.	.	.	.	380	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions