Job Description P11988 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 68 Aligned Residues 308 % Identity 16% Template c2fglA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline thermostable endoxylanase; PDBTitle: an alkali thermostable f/10 xylanase from alkalophilic2 bacillus sp. ng-27 Resolution 2.20 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		Y	E	E	S	F	D	I	G	A	A	V	E	P	H	Q	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	Q	G	K	V	L	K	.	.	H	H	Y	N	S	I	V	A	E	N	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									G	G	G	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.				S					S	S	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.			40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.														140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P	L	.	.	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	A	N	R	A	V	I	D	H
Query Conservation																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	P	I	S	L	Q	P	E	E	G	V	F	T	W	D	G	A	.	.	.	.	.	D	A	I	V	E	F	A	R	K	N	N	M	N	L	R	F	H	T	L	V	W	H	N	Q	V	P	D	W	F	F	L	D	E	E	G	N	P	M	V	E	E	T	N	E	A	K	R	Q	A	N	K	E	L	L	L	E	R
Template Known Secondary structure		T	S						S	B	T	T	B							.	.	.	.	.										T	T								S			S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.						.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.
Query SS confidence																																																																					.
Query Sequence		F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	.	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L
Query Conservation																																																																					.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.																					.	.													.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		L	E	T	H	I	K	T	V	V	E	R	Y	K	D	D	V	T	A	W	D	V	V	N	E	V	V	D	.	.	.	.	.	.	D	G	T	P	N	E	R	G	L	R	E	S	V	W	Y	Q	I	T	G	D	.	.	E	Y	I	R	V	A	F	E	T	A	R	K	Y	A	G	E	D	A	K	L	F	I	N	D	Y
Template Known Secondary structure														T	T	T		S							S		B		.	.	.	.	.	.	S	S		S	S	T	T		B			S							T	T	.	.																T	T	S							S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.							.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	V	T	P	K	R	D	H	L	Y	N	L	V	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	A	D	G	V	P	I	D	G	V	G	H	Q	A	H	I	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T													.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198																														.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.												.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	Q	D	D
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	D	W	P	T	I	D	E	I	R	T	S	M	E	M	F	.	A	G	L	G	L	D	N	Q	V	T	E	L	D	V	S	L	Y	G	W	P	P	R	P	A	F	P	T	Y	D	A	I	P	Q	E	R	F	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S													.		T	T	T												S	S		S	S			S			S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
																											232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.		.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.									.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M	G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	A	D	R	Y	N	Q	L	F	E	L	Y	E	E	L	.	.	.	D	A	D	L	S	S	V	T	F	W	G	I	A	D	N	H	T	W	L	D	D	R	A	R	E	Y	N	D	G	V	G	K	D	A	P	F	V	F	D	P	N	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	P	A	F	W	R	I
Template Known Secondary structure																	T	.	.	.	T	T	T							S	S	S	S	T	T	S		T									T	T	T							S	S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.				.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.											.	.	.	.	.	350	.	.
		452	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	D
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.